More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3548 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3548  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  682    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.89 
 
 
369 aa  401  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.89 
 
 
357 aa  401  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3900  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.69 
 
 
373 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.527564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.16 
 
 
371 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.29 
 
 
367 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0739  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.4 
 
 
362 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.379297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.83 
 
 
373 aa  378  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.39 
 
 
373 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.99 
 
 
352 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2226  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.81 
 
 
359 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.7 
 
 
371 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1807  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.87 
 
 
353 aa  371  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.833313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1754  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.72 
 
 
354 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.994905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2070  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.59 
 
 
353 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1886  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.59 
 
 
353 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3336  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.11 
 
 
353 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.14 
 
 
356 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 
357 aa  365  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.82 
 
 
358 aa  364  1e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.73 
 
 
362 aa  364  1e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.29 
 
 
356 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.4 
 
 
358 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.15 
 
 
359 aa  360  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.32 
 
 
357 aa  359  5e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0850  3-isopropylmalate dehydrogenase  54 
 
 
352 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.898844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.14 
 
 
353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17341  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.36 
 
 
357 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.71 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 
360 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.81 
 
 
357 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 
360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
354 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.71 
 
 
360 aa  355  5e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.89 
 
 
357 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.3 
 
 
357 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0788  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.78 
 
 
357 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.53 
 
 
353 aa  354  1e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.86 
 
 
360 aa  353  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2451  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.3 
 
 
379 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.57 
 
 
362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.29 
 
 
358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.73 
 
 
360 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.15 
 
 
352 aa  352  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09751  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.17 
 
 
360 aa  352  7e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.945321  hitchhiker  0.00220334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.79 
 
 
364 aa  351  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0738  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.57 
 
 
358 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.41 
 
 
360 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.54 
 
 
360 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.47 
 
 
350 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1901  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.89 
 
 
352 aa  350  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.8 
 
 
357 aa  350  2e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.85 
 
 
359 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1260  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.94 
 
 
357 aa  350  3e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366056  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.1 
 
 
357 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.71 
 
 
357 aa  347  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1720  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.28 
 
 
353 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.424747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.99 
 
 
355 aa  346  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0603  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.43 
 
 
353 aa  346  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2524  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.73 
 
 
369 aa  345  6e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.714708  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.67 
 
 
362 aa  345  7e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04390  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.61 
 
 
375 aa  344  1e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.930022 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08261  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.37 
 
 
359 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.842173  normal  0.408942 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.69 
 
 
356 aa  344  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2747  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.46 
 
 
369 aa  344  1e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260828  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.54 
 
 
362 aa  344  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1865  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.07 
 
 
357 aa  344  1e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.436203  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.14 
 
 
360 aa  343  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0194  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.39 
 
 
359 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.18652  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0794  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.55 
 
 
357 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.86487  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.05 
 
 
355 aa  343  2e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5898  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.63 
 
 
358 aa  343  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115502  normal  0.433986 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.15 
 
 
345 aa  343  2e-93  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1100  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.05 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.757445  normal  0.166084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.67 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1425  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.19 
 
 
368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0213  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.58 
 
 
350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.21 
 
 
360 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.12 
 
 
360 aa  342  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2452  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.19 
 
 
369 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0855456  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.72 
 
 
357 aa  342  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3671  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.34 
 
 
356 aa  342  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3041  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.13 
 
 
356 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.34 
 
 
357 aa  341  9e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.28 
 
 
361 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.56 
 
 
357 aa  340  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.99 
 
 
355 aa  340  1e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.28 
 
 
361 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.34 
 
 
363 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3510  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.37 
 
 
370 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100166 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.42 
 
 
356 aa  340  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 
362 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.25 
 
 
356 aa  339  2.9999999999999998e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.59 
 
 
356 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.03 
 
 
357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2173  3-isopropylmalate dehydrogenase  50.57 
 
 
352 aa  339  4e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1483  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.14 
 
 
357 aa  339  5e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.607612  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.89 
 
 
356 aa  339  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1410  3-isopropylmalate dehydrogenase  51.32 
 
 
367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.531545  normal  0.584251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>