More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1034 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1034  Transketolase central region  100 
 
 
332 aa  668    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1944  Transketolase central region  67.59 
 
 
325 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5071  Transketolase central region  64.81 
 
 
325 aa  412  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.067721  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2753  transketolase, central region  49.23 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  46.73 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  47.04 
 
 
327 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  47.04 
 
 
327 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  46.11 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  48.45 
 
 
328 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1047  transketolase, central region  52.19 
 
 
327 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0574878  normal  0.0597249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  48.58 
 
 
320 aa  292  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  48.57 
 
 
324 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  46.08 
 
 
324 aa  288  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1267  transketolase, central region  47.2 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2404  transketolase, central region  49.54 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  47.83 
 
 
328 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  45.94 
 
 
324 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  48.02 
 
 
332 aa  279  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  46.95 
 
 
333 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  46.95 
 
 
333 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  45.4 
 
 
327 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3559  transketolase, central region  45.78 
 
 
337 aa  276  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00351586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2803  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 
344 aa  276  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.475124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2504  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.48 
 
 
344 aa  276  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2779  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 
344 aa  276  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0388974 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2824  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 
344 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.464105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2587  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 
344 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2775  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  44.48 
 
 
344 aa  275  8e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1397  Transketolase central region  43.3 
 
 
327 aa  275  8e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.684408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2538  acetoin dehydrogenase (TPP-dependent) E1 component beta subunit  44.18 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1880  pyruvate dehydrogenase subunit beta  46.84 
 
 
468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2577  transketolase central region  44.18 
 
 
344 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2820  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.65 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2784  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.88 
 
 
344 aa  273  3e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  47.72 
 
 
348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  46.6 
 
 
324 aa  272  5.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  44.55 
 
 
332 aa  272  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6875  transketolase central region  45.99 
 
 
330 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.580767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2509  TPP-dependent acetoin dehydrogenase E1 beta-subunit  43.58 
 
 
344 aa  272  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.398705 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0583  Transketolase central region  45.77 
 
 
344 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.968763 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1776  transketolase, central region  47.26 
 
 
334 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174657  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  43.65 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5126  Transketolase central region  43.22 
 
 
327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3890  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.98 
 
 
456 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440755  normal  0.418556 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1418  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.14 
 
 
456 aa  268  7e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135962 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1217  Transketolase domain protein  44.04 
 
 
330 aa  268  8e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  46.5 
 
 
327 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09281  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.96 
 
 
327 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2490  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.72 
 
 
465 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.423706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2811  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.1 
 
 
469 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.344502  normal  0.77685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3140  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.38 
 
 
467 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5078  transketolase, central region  42.59 
 
 
327 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4178  Transketolase central region  42.37 
 
 
328 aa  267  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008867 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4540  transketolase central region  42.95 
 
 
327 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2770  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.1 
 
 
467 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  46.36 
 
 
336 aa  266  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0149  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.86 
 
 
332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0162  pyruvate dehydrogenase subunit beta  45.82 
 
 
448 aa  266  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00341074 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2910  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.1 
 
 
483 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3015  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.41 
 
 
482 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.259687 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0869  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.32 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3630  transketolase, central region  47.99 
 
 
349 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3625  transketolase, central region  47.99 
 
 
349 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.295636  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3698  transketolase, central region  47.99 
 
 
349 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.453667  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4635  transketolase central region  42.37 
 
 
332 aa  265  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5078  Transketolase central region  47.37 
 
 
322 aa  265  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  49.68 
 
 
325 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0672  Transketolase central region  40.49 
 
 
325 aa  265  8e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  46.39 
 
 
335 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  47.24 
 
 
326 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4402  Transketolase central region  47.06 
 
 
320 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  46.28 
 
 
335 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2269  transketolase, central region  46.69 
 
 
336 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2680  pyruvate dehydrogenase E1 component  42.15 
 
 
326 aa  264  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09301  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  41.32 
 
 
327 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  45.51 
 
 
324 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  45.51 
 
 
324 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2787  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.1 
 
 
469 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  48.6 
 
 
327 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0651  hypothetical protein  40.94 
 
 
325 aa  264  2e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.208884 
 
 
-
 
NC_002620  TC0517  pyruvate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  41.3 
 
 
328 aa  263  3e-69  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2012  transketolase central region  42.06 
 
 
322 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0679386  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  42.72 
 
 
325 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.2 
 
 
324 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3502  Transketolase central region  46.65 
 
 
342 aa  263  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.257276  normal  0.0335061 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1475  transketolase, central region  42.55 
 
 
325 aa  262  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5153  pyruvate dehydrogenase subunit beta  44.58 
 
 
456 aa  262  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.467221  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0929  pyruvate dehydrogenase complex, E1 component, pyruvate dehydrogenase beta subunit  43.93 
 
 
324 aa  261  8e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1727  transketolase, central region  42.06 
 
 
322 aa  261  8.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.35739  normal  0.316381 
 
 
-
 
NC_002978  WD0473  pyruvate dehydrogenase subunit beta  41.67 
 
 
332 aa  261  1e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.867083  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4462  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.55 
 
 
459 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3050  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  47.44 
 
 
331 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  47.52 
 
 
657 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3759  transketolase central region  46.95 
 
 
334 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556594  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1601  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  43.94 
 
 
337 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0593  transketolase, central region  44.71 
 
 
340 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.90523  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  45.51 
 
 
324 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  43.34 
 
 
330 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0535  pyruvate dehydrogenase subunit beta  42.24 
 
 
454 aa  260  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  46.56 
 
 
351 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>