More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2653 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  42.49 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1213  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  44.95 
 
 		 482 aa  171  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1068  tyrosine-protein kinase  44.28 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  40.98 
 
 		 232 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  41.83 
 
 		 464 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  40.19 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  37.38 
 
 		 734 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  36.41 
 
 		 722 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  37.13 
 
 		 217 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  40 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.78 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  37.56 
 
 		 790 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  36.63 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  35.71 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  35.68 
 
 		 741 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  38.66 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1172  cpsD protein  39.07 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.748604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  39.02 
 
 		 225 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  34.76 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  34.76 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  39.02 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  38.54 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  34.29 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  39.02 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  37.09 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  35.24 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  36.27 
 
 		 509 aa  148  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  36.49 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  33.18 
 
 		 742 aa  148  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.2 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.2 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.81 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  35 
 
 		 472 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  37.56 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  34.26 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.63 
 
 		 463 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  36.98 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  36.19 
 
 		 454 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  36 
 
 		 496 aa  139  4.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0541  capsular exopolysaccharide family  39.22 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  32.59 
 
 		 605 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  33.95 
 
 		 737 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  32.13 
 
 		 615 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  31.67 
 
 		 667 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  34.23 
 
 		 736 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0621  capsular exopolysaccharide family  35.03 
 
 		 726 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.242447  normal  0.136345 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2687  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.88 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2744  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.88 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0560  protein-tyrosine kinase  33.5 
 
 		 492 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.271143  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05860  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  34.11 
 
 		 524 aa  133  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.517832  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.8 
 
 		 739 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  33.48 
 
 		 503 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  30.64 
 
 		 624 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2533  protein-tyrosine kinase  36.14 
 
 		 802 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3404  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.6 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00848041  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0919  tyrosine-protein kinase protein  41.05 
 
 		 205 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000101263  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  37.31 
 
 		 735 aa  130  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  34.54 
 
 		 505 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0580  tyrosine-protein kinase  36.55 
 
 		 759 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.298329  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2854  capsular exopolysaccharide family  39.47 
 
 		 525 aa  129  6e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  34 
 
 		 804 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  34.5 
 
 		 490 aa  128  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  30.89 
 
 		 721 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1061  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  32.02 
 
 		 730 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4915  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  29.86 
 
 		 741 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113292 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3727  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.81 
 
 		 741 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.601241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0956  lipopolysaccharide biosynthesis  35.86 
 
 		 466 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.296448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5550  hypothetical protein  30.81 
 
 		 741 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1505  tyrosine-protein kinase  37.13 
 
 		 585 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3700  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.81 
 
 		 741 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22230  Non-specific protein-tyrosine kinase  35.21 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  30.8 
 
 		 745 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4539  protein-tyrosine kinase  30.81 
 
 		 741 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.267128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  35.68 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3824  hypothetical protein  30.81 
 
 		 741 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1906  capsular exopolysaccharide family  35.16 
 
 		 795 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4925  capsular exopolysaccharide family protein  31.48 
 
 		 739 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2893  non-specific protein-tyrosine kinase  32.56 
 
 		 727 aa  125  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.22224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0726  capsular exopolysaccharide family  35.44 
 
 		 783 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  29.91 
 
 		 746 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  36.79 
 
 		 774 aa  125  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2272  protein-tyrosine kinase  29.86 
 
 		 741 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.994718  normal  0.103014 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  33.67 
 
 		 508 aa  125  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1775  capsular exopolysaccharide family  34.12 
 
 		 803 aa  125  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00109135  normal  0.0290835 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  35.53 
 
 		 492 aa  125  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  36.22 
 
 		 733 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4084  acetyltransferase  33.5 
 
 		 733 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182153  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  30.36 
 
 		 747 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0964  lipopolysaccharide biosynthesis  33.67 
 
 		 497 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3034  tyrosine kinase  36.73 
 
 		 723 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2242  protein-tyrosine kinase  31.28 
 
 		 740 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  34.62 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  33.49 
 
 		 756 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1298  tyrosine kinase  36.22 
 
 		 724 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  33.18 
 
 		 730 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2447  capsular exopolysaccharide family  33.66 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0946  protein-tyrosine kinase  33.67 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.484543  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02900  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  32.38 
 
 		 453 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>