76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3222 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_3222  glutaredoxin  100 
 
 		 115 aa  241  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42020  hypothetical protein  50.53 
 
 		 123 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3567  hypothetical protein  49.47 
 
 		 123 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001457  glutaredoxin  50.53 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05393  hypothetical protein  51.58 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0816  putative glutaredoxin  47.87 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1430  glutaredoxin  47.37 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11658  normal  0.297548 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1899  glutaredoxin  42.72 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.508072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2745  glutaredoxin  49.47 
 
 		 122 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0841717  normal  0.856746 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1688  glutaredoxin  48.42 
 
 		 118 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1400  glutaredoxin  47.37 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.111122  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1822  glutaredoxin  47.37 
 
 		 123 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0545572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3889  glutaredoxin  47.37 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.280842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1710  glutaredoxin  47.37 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.382993  normal  0.506968 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0167  glutaredoxin family protein  50.52 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.08495 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1673  glutaredoxin  46.32 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2669  glutaredoxin  46.32 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0368347  normal  0.0510929 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2410  glutaredoxin  46.32 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.786564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2417  glutaredoxin  47.37 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.656384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2487  glutaredoxin  47.37 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0780124  normal  0.16751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2579  glutaredoxin  47.37 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1562  glutaredoxin  46.32 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2797  hypothetical protein  48.31 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1714  hypothetical protein  50.62 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2758  glutaredoxin  42.48 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.334545  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1103  glutaredoxin family protein  43.3 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000207624  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1032  glutaredoxin  46.32 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.783959  normal  0.67876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2034  hypothetical protein  46.32 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1830  glutaredoxin  46.32 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0383849  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3634  hypothetical protein  45.16 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4059  glutaredoxin  41.05 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1501  glutaredoxin  45.26 
 
 		 118 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.676522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1844  hypothetical protein  45.26 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.322707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0951  glutaredoxin  46.32 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.40724  normal  0.0261252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1594  glutaredoxin  45.16 
 
 		 118 aa  87.8  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3628  glutaredoxin  43.16 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2379  glutaredoxin family protein  42.27 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.272824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1598  glutaredoxin  37.89 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328495  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0827  putative glutaredoxin  46.15 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1540  ATP-dependent helicase HrpB  40.22 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2005  glutaredoxin  40.43 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.916013  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0213  glutaredoxin  44.71 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.989623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  41.18 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5304  glutaredoxin  44 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11170  glutaredoxin  45.83 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29383  predicted protein  36.47 
 
 		 309 aa  62  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.066564  normal  0.454968 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1175  glutaredoxin  32.91 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1387  glutaredoxin  38.81 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.252635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1787  glutaredoxin  33.75 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.75758  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12420  glutaredoxin-like protein  44 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0847  glutaredoxin  33.75 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.352603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1950  glutaredoxin  37.18 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000181605  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2195  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.59 
 
 		 284 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2053  hypothetical protein  37.08 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2423  glutaredoxin  29.11 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0256  glutaredoxin  32.91 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.296093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07400  glutaredoxin-like protein  39.74 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26662  predicted protein  33.33 
 
 		 317 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2107  glutaredoxin  29.9 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.367569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0406  glutaredoxin  29.11 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.394009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  34.43 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  34.43 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1084  glutaredoxin  30.49 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  33.85 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0554  glutaredoxin  31.65 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1282  Glutathione S-transferase domain protein  32.91 
 
 		 225 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  29.73 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  35.82 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  32.79 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  35.82 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0886  glutaredoxin  29.11 
 
 		 87 aa  40.8  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2863  putative lignin beta-etherase  33.78 
 
 		 222 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2946  glutaredoxin  31.65 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.758078  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  32.76 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>