164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6561 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6561  putative transmembrane transporter  100 
 
 		 556 aa  1100    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 488 aa  327  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  33.63 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  28.78 
 
 		 485 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  27.32 
 
 		 436 aa  184  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  27.82 
 
 		 420 aa  178  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  30.04 
 
 		 426 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  27.53 
 
 		 435 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  28.3 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  28.3 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  28.3 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  28.3 
 
 		 423 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  28.3 
 
 		 423 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  27.66 
 
 		 428 aa  173  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  28.52 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  29.25 
 
 		 423 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  29.06 
 
 		 423 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  27.96 
 
 		 424 aa  170  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  28.98 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  29.14 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  26.69 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  27.34 
 
 		 435 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  27.21 
 
 		 424 aa  163  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  26.26 
 
 		 436 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  26.92 
 
 		 431 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  34.96 
 
 		 471 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  26.57 
 
 		 440 aa  138  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  28.04 
 
 		 427 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  26.37 
 
 		 431 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  27.35 
 
 		 408 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  26.01 
 
 		 431 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  27.08 
 
 		 408 aa  131  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  26.79 
 
 		 403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  35.17 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  24.07 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1420  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  25.09 
 
 		 405 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  24.73 
 
 		 429 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  36.44 
 
 		 415 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  36.44 
 
 		 415 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  34.22 
 
 		 417 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  30.65 
 
 		 428 aa  114  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  36.04 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  23.87 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1540  L-fucose permease  23.58 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.284647  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6289  L-fucose transporter  23.58 
 
 		 457 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.642767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  22.76 
 
 		 437 aa  110  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.98 
 
 		 421 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1486  glucose/galactose transporter  24.95 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  24.09 
 
 		 440 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  35.6 
 
 		 421 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 		 389 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  29.32 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  32.77 
 
 		 437 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  24.91 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  24.91 
 
 		 432 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  26.85 
 
 		 412 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  25.84 
 
 		 432 aa  103  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  24.91 
 
 		 432 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  24.72 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  35.39 
 
 		 435 aa  100  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  24.54 
 
 		 432 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  24.54 
 
 		 432 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  22.94 
 
 		 446 aa  99.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  29.63 
 
 		 417 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  24.72 
 
 		 432 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  22.16 
 
 		 441 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  30.93 
 
 		 410 aa  98.2  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  33.49 
 
 		 458 aa  97.4  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  24.24 
 
 		 419 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  22.7 
 
 		 406 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0960  fucose permease  23.56 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.608891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  40.24 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0872  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 426 aa  94.7  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  23.6 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0536  L-fucose permease  28.32 
 
 		 418 aa  94.4  5e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.186143  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0644  L-fucose transporter  29.22 
 
 		 409 aa  94  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510185  normal  0.606188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  40.24 
 
 		 413 aa  94  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.89 
 
 		 431 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  22.53 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  30.38 
 
 		 429 aa  92.8  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 452 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 452 aa  91.3  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1448  L-fucose permease  27.43 
 
 		 418 aa  90.5  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  27.46 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  29.13 
 
 		 441 aa  89.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  28.88 
 
 		 412 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 452 aa  87.4  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  27.9 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17660  fucose permease  28.77 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.634966  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  30 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4044  L-fucose transporter  25.83 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3300  L-fucose transporter  29.29 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3137  L-fucose transporter  29.29 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.436667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3120  L-fucose transporter  29.29 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.38497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3185  L-fucose transporter  29.29 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.780035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3200  L-fucose transporter  29.29 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1612  L-fucose transporter  27.19 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0487027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  27.43 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  26.57 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>