66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5199 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 477 aa  979    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  43.49 
 
 		 651 aa  309  9e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  41.02 
 
 		 581 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  35.73 
 
 		 631 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 750 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  31.49 
 
 		 671 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  30.37 
 
 		 598 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  30.28 
 
 		 700 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  29.02 
 
 		 660 aa  150  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  30.29 
 
 		 423 aa  109  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  24.59 
 
 		 858 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  24.44 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  31.58 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  28.41 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  30.41 
 
 		 750 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  25.1 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  25.1 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  25.1 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  25.27 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  34 
 
 		 596 aa  68.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  28.04 
 
 		 589 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  32.37 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  22.52 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  29.02 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  28.5 
 
 		 640 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  35.42 
 
 		 562 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  28.5 
 
 		 629 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  28.5 
 
 		 629 aa  67  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  29.17 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  29.63 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  34.95 
 
 		 617 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  27.03 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  30.5 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  29.45 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  38.54 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  26.26 
 
 		 747 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  34.65 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  21.35 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  30 
 
 		 322 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  31.25 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  26.32 
 
 		 647 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  27.64 
 
 		 632 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  26.13 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  34.52 
 
 		 719 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  28.78 
 
 		 614 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  22.16 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  28.75 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 		 330 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  28.87 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  30.77 
 
 		 590 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 		 330 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  28.57 
 
 		 330 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  29.27 
 
 		 413 aa  47  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  22.95 
 
 		 585 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  42.86 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  23.84 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  27.62 
 
 		 380 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  26.14 
 
 		 585 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  37.18 
 
 		 596 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  20.66 
 
 		 754 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  28 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1006  heat shock protein HtpX  38.89 
 
 		 292 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  27.07 
 
 		 631 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1196  heat shock protein HtpX  38.89 
 
 		 292 aa  43.9  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0795  peptidase M48 Ste24p  27.43 
 
 		 274 aa  43.5  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  26.47 
 
 		 585 aa  43.5  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>