58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3983 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3983  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 455 aa  922    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1000  outer membrane efflux protein  43.57 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495217  normal  0.0302884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6010  outer membrane efflux protein  31.82 
 
 		 462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0509  outer membrane efflux protein  29.34 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  21.06 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 458 aa  68.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  18.81 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  22.2 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  26.74 
 
 		 456 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  25.45 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 443 aa  53.1  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.32 
 
 		 627 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  23.13 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  22.14 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  23.13 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2479  outer membrane efflux protein  24.23 
 
 		 454 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  23.31 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1477  outer membrane efflux protein  24.67 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6012  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.96 
 
 		 499 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3381  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.55 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5768  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.53 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20317  normal  0.984778 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1591  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  20.8 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000292967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.08 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2391  outer membrane efflux protein  24.67 
 
 		 454 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0837575  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  20.34 
 
 		 453 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 427 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 439 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  21.05 
 
 		 455 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 		 454 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 		 635 aa  47  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  21.46 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  18.79 
 
 		 476 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  20.47 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6660  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.29 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.958876 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  46.43 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  20.46 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  23.53 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.13 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  27.01 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6180  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.29 
 
 		 498 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0879819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7725  RND efflux system outer membrane lipoprotein  21.36 
 
 		 499 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0124  outer membrane efflux protein  27.94 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.638422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  23.38 
 
 		 437 aa  43.9  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0891  outer membrane efflux protein  20.67 
 
 		 508 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2657  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.93 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0121184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  21.78 
 
 		 419 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  20.29 
 
 		 463 aa  43.1  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  21.12 
 
 		 497 aa  43.1  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>