More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1556 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1556  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0010  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.75 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2973  two component LuxR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6821  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 225 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121688  normal  0.121136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4294  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.87 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81327  normal  0.0351026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5476  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.21854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5845  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0036  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0464925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2963  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.16 
 
 		 219 aa  131  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 211 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3747  two component LuxR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2571  transmission activator LetA  34.42 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2699  transmission activator LetA  34.42 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2375  two component LuxR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.405291  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2897  LuxR response regulator receiver  32.71 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.017691  normal  0.317002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  33.63 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  32.24 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  32.24 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3375  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 212 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3024  DNA-binding response regulator GacA  31.78 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3957  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  34.86 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3067  two component LuxR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598248 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4099  DNA-binding response regulator GacA  33.64 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.427607  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1765  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456405  hitchhiker  0.00257365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  34.4 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 215 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25030  Response regulator GacA  33.33 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  34.09 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  33.94 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  33.94 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2325  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 214 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.429674  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.11 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3299  LuxR response regulator receiver  33.64 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0158345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.51 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  29.77 
 
 		 211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.11 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.82 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2780  two component LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1260  putative nitrate/nitrite DNA-binding response regulator  31.13 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2907  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.65 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0590247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  29.95 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2126  LuxR family DNA-binding response regulator  32.56 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118459  normal  0.107719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  30.52 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  30.52 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  30.52 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  31.48 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  30.52 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  30.52 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1311  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165019  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.69 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  30.37 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 220 aa  109  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  30.7 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1643  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.118638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  31.82 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  29.58 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1563  two component LuxR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.241819 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.41 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3526  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.27 
 
 		 220 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0134281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  32.26 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 219 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  30.84 
 
 		 214 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2312  two-component response regulator transcription regulator protein  30.99 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  30.41 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>