109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1176 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1176  intradiol ring-cleavage dioxygenase  100 
 
 
244 aa  498  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3769  intradiol ring-cleavage dioxygenase  46.12 
 
 
237 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1680  intradiol ring-cleavage dioxygenase  43.67 
 
 
236 aa  189  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2243  intradiol ring-cleavage dioxygenase  40.78 
 
 
250 aa  179  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2843  intradiol ring-cleavage dioxygenase  37.57 
 
 
233 aa  129  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.75 
 
 
309 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7382  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.69 
 
 
266 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.203989  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1942  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.13 
 
 
234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.842989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2095  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.08 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.781627  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2416  intradiol ring-cleavage dioxygenase  35.36 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.39 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5241  twin-arginine translocation pathway signal  36.75 
 
 
238 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1128  protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit like protein  33.51 
 
 
252 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.608028  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1876  intradiol ring-cleavage dioxygenase  36.32 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3226  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.15 
 
 
248 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3523  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.68 
 
 
288 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1587  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.59 
 
 
299 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0924  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.18 
 
 
318 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4839  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.79 
 
 
282 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2567  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.82 
 
 
258 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3772  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.92 
 
 
281 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1202  twin-arginine translocation pathway signal  31.52 
 
 
252 aa  103  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2254  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.21 
 
 
258 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.802404 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01301  conserved hypothetical protein  34.22 
 
 
383 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4377  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.86 
 
 
319 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3143  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.19 
 
 
310 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.529872  hitchhiker  0.00328294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3783  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.51 
 
 
328 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83161  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.5 
 
 
304 aa  99.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07161  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03070)  29.46 
 
 
377 aa  98.6  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0585073  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4129  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.17 
 
 
303 aa  98.6  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5275  putative intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.11 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.317456  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0716  dioxygenase family protein  27.47 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0187  hypothetical protein  27.47 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00856526  hitchhiker  0.0000433457 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0789  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.47 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0037  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.36 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3212  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.05 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16460  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  32.16 
 
 
294 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574366  normal  0.703195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0108  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
327 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3940  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.34 
 
 
325 aa  95.1  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187002 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3911  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.84 
 
 
308 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1781  intradiol ring-cleavage dioxygenase  32.18 
 
 
323 aa  92  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4360  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.12 
 
 
238 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04370  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta subunit  31.66 
 
 
349 aa  91.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3841  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.53 
 
 
343 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.353412  normal  0.439298 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1809  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28 
 
 
311 aa  88.6  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.510661  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2526  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.5 
 
 
331 aa  88.2  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03340  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 
318 aa  82  0.000000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0104433  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04203  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.587359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  34.33 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05398  extracellular dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14630)  26.37 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05328  GPI anchored dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01800)  28.18 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.628853  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3903  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.38 
 
 
327 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0806083 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09268  conserved hypothetical protein  28.77 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1294  catechol 1,2-dioxygenase  27.33 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4070  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.4 
 
 
192 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0120  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.58 
 
 
191 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0339331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1486  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.28 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2592  intradiol ring-cleavage dioxygenase  29.5 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  30.83 
 
 
271 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1176  catechol 1,2-dioxygenase  31 
 
 
312 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.598074  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05532  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain protein  30.08 
 
 
190 aa  53.1  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2786  intradiol ring-cleavage dioxygenase  28.99 
 
 
190 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02906  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  30.33 
 
 
242 aa  52.8  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1849  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  27.21 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07946  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
280 aa  49.7  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6473  catechol dioxygenase, N-terminal  25.95 
 
 
253 aa  48.9  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2441  intradiol ring-cleavage dioxygenase  33.64 
 
 
301 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1130  3-chlorocatechol 1,2-dioxygenase  29.41 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5025  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  28.23 
 
 
233 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.32623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0836  catechol 1,2-dioxygenase  24.5 
 
 
287 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3889  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  31.03 
 
 
234 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4110  Hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  26.19 
 
 
287 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19220  catechol 1,2-dioxygenase  26.71 
 
 
287 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.184485  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0748  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.88 
 
 
300 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3237  catechol 1,2-dioxygenase  25.87 
 
 
311 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.315319 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2988  intradiol ring-cleavage dioxygenase  26.67 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1376  catechol 1,2-dioxygenase  28.3 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1394  catechol 1,2-dioxygenase  28.3 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127485  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1410  catechol 1,2-dioxygenase  28.3 
 
 
287 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1590  catechol 1,2-dioxygenase  26.06 
 
 
311 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31335  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1119  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.91 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00412306  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2775  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit(PcaH)  28.57 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000406236  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4013  protocatechuate (dihdydroxy benzoate) 3,4-dioxygenase subunit beta  26.61 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1933  catechol 1,2-dioxygenase  23.56 
 
 
297 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  26.9 
 
 
234 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321116  normal  0.293575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0130  intradiol ring-cleavage dioxygenase  27.82 
 
 
300 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4154  catechol 1,2-dioxygenase  23.08 
 
 
290 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.636765  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001576  protocatechuate 3,4-dioxygenase beta chain  24.62 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1781  catechol 1,2-dioxygenase  28.57 
 
 
305 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0645498  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4890  hydroxyquinol 1,2-dioxygenase  29.59 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.352228  normal  0.0244252 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4566  intradiol ring-cleavage dioxygenase  31.71 
 
 
303 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.395963 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0981  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.06 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00626299  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0318  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.06 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0394  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.06 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.187163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0245  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.06 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000128841  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1845  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.06 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0795201  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1760  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.06 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00117633  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1351  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.06 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.010139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0627  protocatechuate 3,4-dioxygenase, beta subunit  29.31 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.799522  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2329  catechol dioxygenase  31 
 
 
300 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>