67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1137 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1137  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 375 aa  770    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.451573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7035  TPR repeat-containing protein  28.01 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000302282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  25.69 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 594 aa  56.2  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.9 
 
 		 565 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 3035 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 562 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 732 aa  50.8  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.62 
 
 		 810 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.05 
 
 		 662 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06745  TPR repeat protein  20.47 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  37.29 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 409 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2252  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 954 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 3145 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 3172 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 718 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  20.65 
 
 		 543 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.49 
 
 		 1486 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 2059 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 878 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 279 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 1184 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 605 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 3560 aa  46.2  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.02 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  23.89 
 
 		 632 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.78 
 
 		 1252 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 605 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1827 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  25.7 
 
 		 780 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 		 729 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 		 265 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  26.19 
 
 		 1213 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  21.39 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 		 1056 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0986  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461111 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  23.49 
 
 		 681 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.3 
 
 		 689 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  23.44 
 
 		 520 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2812  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 		 1838 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.4844  normal  0.543205 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.53 
 
 		 816 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 284 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  24.81 
 
 		 661 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1768  heat shock protein DnaJ-like  26.62 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0454464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.91 
 
 		 1154 aa  43.9  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 611 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 486 aa  43.5  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1142  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 331 aa  43.5  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  18.52 
 
 		 607 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1133 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  27.03 
 
 		 581 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 637 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  25.6 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 836 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63418  predicted protein  25 
 
 		 404 aa  42.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316998  normal  0.630881 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 214 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.17 
 
 		 927 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.85 
 
 		 784 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>