153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2660 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2660  aldose 1-epimerase  100 
 
 		 306 aa  636    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2023  aldose 1-epimerase  25.67 
 
 		 298 aa  93.2  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0702  Aldose 1-epimerase  28.84 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0950  Aldose 1-epimerase  27.35 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0322782 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0324  Aldose 1-epimerase  25.38 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.296431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1015  Aldose 1-epimerase  26.53 
 
 		 311 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0149  Aldose 1-epimerase  25.82 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0125238 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1585  Aldose 1-epimerase  26.15 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.92898  normal  0.309256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1083  hypothetical protein  25.1 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000316766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3963  aldose 1-epimerase  25.81 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.87118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2372  aldose 1-epimerase  25.2 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0523  Aldose 1-epimerase  23.75 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1638  Aldose 1-epimerase  23.79 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.104568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2489  Aldose 1-epimerase  21.68 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4338  hypothetical protein  24.9 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2182  Aldose 1-epimerase  24.07 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000157648 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4277  aldose 1-epimerase  25.22 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.436668 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2057  aldose 1-epimerase  21.86 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.107394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0514  aldose 1-epimerase  24.01 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.165305  decreased coverage  0.000622322 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3398  aldose 1-epimerase  21.11 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.226465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51460  aldose 1-epimerase  29.33 
 
 		 285 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5831  aldose 1-epimerase  24.5 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0718685  normal  0.204267 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3479  aldose 1-epimerase  22.87 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0402  hypothetical protein  22.87 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.827093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1262  hypothetical protein  22.87 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3444  aldose 1-epimerase family protein  22.87 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3482  aldose 1-epimerase family protein  22.87 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3303  hypothetical protein  22.87 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3760  Aldose 1-epimerase  20.88 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00879497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3707  Aldose 1-epimerase  21.05 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2482  hypothetical protein  22.87 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1836  Aldose 1-epimerase  24.1 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0383  Aldose 1-epimerase  23.49 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2241  Aldose 1-epimerase  22.78 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.61015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2846  Aldose 1-epimerase  23.74 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.985751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0551  putative aldose-1-epimerase  24.07 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530428  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2583  Aldose 1-epimerase  25.81 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4435  Aldose 1-epimerase  23.92 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.340797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2993  Aldose 1-epimerase  24.7 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.778062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2623  aldose 1-epimerase  23.74 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.187732 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0696  Aldose 1-epimerase  24.32 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2754  hypothetical protein  24.69 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.494847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1183  aldose 1-epimerase  23.33 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3405  Aldose 1-epimerase  23.65 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237068  normal  0.0908294 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0225  galactose mutarotase  24.19 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000500571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0226  galactose mutarotase  24.1 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00706113  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33650  galactose mutarotase-like enzyme  23.92 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0426  aldose 1-epimerase  23.46 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4297  aldose-1-epimerase family protein  24.83 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4343  aldose-1-epimerase family protein  24.83 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4252  aldose-1-epimerase family protein  24.83 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2029  aldose 1-epimerase  23.77 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.99913  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1225  Aldose 1-epimerase  20.91 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2192  galactose mutarotase-like protein  23.05 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1322  aldose 1-epimerase  25.58 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000155463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2178  Aldose 1-epimerase  23.68 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1927  lacX protein  26.56 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1897  aldose 1-epimerase  22.22 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2432  aldose 1-epimerase  23.67 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0573284  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0256  aldose 1-epimerase  23.88 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1715  lacX protein, putative  27.03 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.725211  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1278  Aldose 1-epimerase  19.78 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.265427  normal  0.286232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1765  putative lacX protein  27.03 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2260  aldose 1-epimerase  23.72 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420753  unclonable  0.0000000181907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3046  Aldose 1-epimerase  25.17 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal  0.148483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2997  Aldose 1-epimerase  22.7 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0656  aldose-1-epimerase  24.66 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.629793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1267  Aldose 1-epimerase  20.08 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560353  hitchhiker  0.00115827 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1743  hypothetical protein  22.18 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.574419  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0550  aldose 1-epimerase  21.51 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0177374  normal  0.655719 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3707  aldose 1-epimerase  20.4 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.405661  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2550  Aldose 1-epimerase  24.8 
 
 		 289 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0526  aldose 1-epimerase  22.7 
 
 		 353 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2973  Aldose 1-epimerase  21.03 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000377273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2760  aldose 1-epimerase  21.08 
 
 		 353 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.385741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0628  aldose 1-epimerase  24.41 
 
 		 282 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2610  aldose 1-epimerase  22.97 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.169817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2653  Aldose 1-epimerase  21.21 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3303  putative aldose-1-epimerase  23.48 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12920  galactose mutarotase-like enzyme  26.25 
 
 		 321 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0901551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2443  hypothetical protein  24.54 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5648  Aldose 1-epimerase  23.18 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0726  Aldose 1-epimerase  21.99 
 
 		 328 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1173  hypothetical protein  28.29 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1024  galactose mutarotase-like protein  27.38 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.353327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3685  putative lacX protein  24.71 
 
 		 290 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0142  aldose 1-epimerase  20 
 
 		 353 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0625  aldose 1-epimerase  20 
 
 		 353 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1512  aldose 1-epimerase  26.25 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1660  putative lacX protein  24.71 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20481  galactose mutarotase-like protein  28.29 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.786913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5326  aldose-1-epimerase family protein  22.61 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.6155 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1674  aldose 1-epimerase  21.9 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.416242  hitchhiker  0.00123529 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2454  aldose 1-epimerase  20.14 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0044  Aldose 1-epimerase  22.87 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1886  aldose 1-epimerase  22.01 
 
 		 382 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3343  aldose 1-epimerase  23.92 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  0.850547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0593  aldose 1-epimerase  20 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.112152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1761  Aldose 1-epimerase  19.92 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1480  lacX protein  26.25 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.383068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>