More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0227 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  709    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  55.49 
 
 		 338 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  37.16 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  34.73 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  35.54 
 
 		 340 aa  192  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  34.94 
 
 		 343 aa  192  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  34.72 
 
 		 339 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  36.09 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  35.53 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  33.12 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  33.73 
 
 		 341 aa  188  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  33.13 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  32.54 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  31.79 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  32.84 
 
 		 339 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  32.55 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  32.73 
 
 		 331 aa  176  8e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  30.26 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  32.74 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  32.21 
 
 		 318 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  31.46 
 
 		 330 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  31.66 
 
 		 590 aa  170  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.23 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  31.06 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  31.94 
 
 		 348 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.5 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  30.95 
 
 		 365 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  31.48 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  30.33 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.2 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  30.37 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  31.91 
 
 		 366 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  31.01 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  30.42 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  29.31 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  30.21 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  29.82 
 
 		 338 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.36 
 
 		 341 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  32.13 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  29.22 
 
 		 339 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  29.52 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.82 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  29.82 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.82 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  29.82 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  29.52 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  32.18 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  29.86 
 
 		 367 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  29.22 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  29.52 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  28.96 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  28.53 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  29.48 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  30.97 
 
 		 343 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  29.34 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  28.61 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  29.07 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  30.9 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.03 
 
 		 340 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  28.23 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  26.95 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  27.67 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  27.86 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  28.96 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  29.76 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  28.4 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  26.99 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  25.9 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  29.86 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  27.85 
 
 		 344 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  28.53 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  25.49 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.58 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  26.33 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  23.73 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  23.17 
 
 		 642 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  28.4 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  22.79 
 
 		 643 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  26.4 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  27.85 
 
 		 318 aa  99.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  27.55 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.19 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  24.69 
 
 		 312 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  26.32 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  24 
 
 		 306 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  27.62 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 329 aa  97.1  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  25.87 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  24.77 
 
 		 319 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.15 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  26.61 
 
 		 338 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  25.54 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.33 
 
 		 323 aa  93.2  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  25.41 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  27.4 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  25 
 
 		 343 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  22.16 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>