More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0080 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0080  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  430  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1863  LuxR family DNA-binding response regulator  51.92 
 
 		 218 aa  221  8e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.345514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1913  DNA-binding response regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 212 aa  221  9e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.605645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1059  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 221 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1659  LuxR family DNA-binding response regulator  51.44 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1637  response regulator  51.44 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1791  LuxR family DNA-binding response regulator  51.44 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.276817  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1839  DNA-binding response regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 212 aa  218  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1656  two component LuxR family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 224 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145564  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1606  response regulator  51.44 
 
 		 212 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1802  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.96 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3538  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.96 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 217 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.89 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.05 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 222 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 218 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.93 
 
 		 211 aa  157  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.64 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6980  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.89 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  41.79 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.71 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 229 aa  151  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  37.8 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.9 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.75 
 
 		 226 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.96 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.93 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3754  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.52 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00290124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1951  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.23 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  40.67 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3998  response regulator receiver protein  39.41 
 
 		 233 aa  148  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.363745  normal  0.263649 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.81 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.73 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.67 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 213 aa  148  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  38.86 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 234 aa  147  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  37.44 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  37.67 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  36.06 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10690  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.95 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.55 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  37.79 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  39.11 
 
 		 239 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1350  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.89 
 
 		 249 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.44 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>