More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2092 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2092  O-succinylbenzoate-CoA synthase  100 
 
 
357 aa  724    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2051  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  58.82 
 
 
356 aa  408  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2434  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  55.46 
 
 
357 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0327  O-succinylbenzoate-CoA synthase  50.42 
 
 
357 aa  351  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.012502 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1718  O-succinylbenzoate-CoA synthase  49.86 
 
 
363 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1881  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  42.62 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2078  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.13 
 
 
365 aa  271  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.310676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0587  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.63 
 
 
359 aa  130  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2892  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  37.74 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.32058  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0563  O-succinylbenzoate synthase  29.39 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00751682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3280  O-succinylbenzoate synthase  30.19 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0190  O-succinylbenzoate-CoA synthase  32.53 
 
 
337 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1592  O-succinylbenzoate synthase  30.52 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1782  O-succinylbenzoate synthase  30.52 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.495059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1485  O-succinylbenzoate synthase  31.17 
 
 
323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1102  O-succinylbenzoate synthase  27.68 
 
 
324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3200  O-succinylbenzoate synthase  30.42 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1114  O-succinylbenzoate synthase  30.67 
 
 
323 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.236827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2534  O-succinylbenzoate synthase  29.13 
 
 
320 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02188  O-succinylbenzoate synthase  28.8 
 
 
320 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1396  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.8 
 
 
320 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02147  hypothetical protein  28.8 
 
 
320 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1387  O-succinylbenzoate synthase  28.8 
 
 
320 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2442  O-succinylbenzoate synthase  28.8 
 
 
320 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0308948  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2491  O-succinylbenzoate synthase  27.84 
 
 
320 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2546  O-succinylbenzoate synthase  27.84 
 
 
320 aa  102  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157759  normal  0.70681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2416  O-succinylbenzoate synthase  28.8 
 
 
320 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0291252  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3011  O-succinylbenzoate synthase  29.49 
 
 
322 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3403  O-succinylbenzoate synthase  28.48 
 
 
320 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.079647  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2557  O-succinylbenzoate synthase  28.48 
 
 
320 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54989  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2640  O-succinylbenzoate synthase  28.48 
 
 
320 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00569926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3973  O-succinylbenzoate synthase  27.76 
 
 
357 aa  99.8  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004029  O-succinylbenzoate-CoA synthase  27.88 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3601  O-succinylbenzoate synthase  28.31 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1048  O-succinylbenzoate synthase  30 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0416842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2407  O-succinylbenzoate synthase  28.16 
 
 
320 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.261329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3556  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.97 
 
 
363 aa  93.2  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.21436  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0393  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.04 
 
 
342 aa  92.8  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.182534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3462  O-succinylbenzoate synthase  28.65 
 
 
367 aa  92.8  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2811  O-succinylbenzoate synthase  28.21 
 
 
321 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.955541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2650  O-succinylbenzoate synthase  28.19 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.128431  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01432  O-succinylbenzoate synthase  27.18 
 
 
329 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1558  O-succinylbenzoate synthase  29.86 
 
 
332 aa  90.5  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0280  O-succinylbenzoate synthase  27.33 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2249  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.34 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2232  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.64 
 
 
309 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.469414  normal  0.296899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0224  O-succinylbenzoate synthase  26.76 
 
 
351 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3769  O-succinylbenzoate synthase  28.84 
 
 
349 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.677399  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1522  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.71 
 
 
356 aa  85.5  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3967  O-succinylbenzoate synthase  26.26 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1130  O-succinylbenzoate-CoA synthase  28.12 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.258184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5719  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.13 
 
 
388 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1615  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.91 
 
 
318 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384502  normal  0.740788 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0207  O-succinylbenzoate synthase  29.12 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.500641  hitchhiker  0.0000148357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2370  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.8 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3842  O-succinylbenzoate synthase  28.07 
 
 
349 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.814694  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11263  chloromuconate cycloisomerase  26.01 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4068  O-succinylbenzoate synthase  28.09 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  unclonable  0.0000591111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0176  O-succinylbenzoate synthase  27.35 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.897606  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4159  O-succinylbenzoate synthase  27.43 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2635  O-succinylbenzoate synthase  28.62 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1207  O-succinylbenzoate synthase  26.89 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3489  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  24.83 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2020  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.44 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2788  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25.94 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1775  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  25 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1236  O-succinylbenzoate synthase  26.59 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0203979  normal  0.74541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4575  O-succinylbenzoate synthase  27.23 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0177  O-succinylbenzoate synthase  26.84 
 
 
366 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1410  O-succinylbenzoate synthase  30.7 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4290  O-succinylbenzoate synthase  26.84 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0311  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.48 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0319  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.15 
 
 
369 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0256  N-acylamino acid racemase  24.27 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0874695  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0324  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.9 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0308  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.15 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0339  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.9 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0308  O-succinylbenzoate synthase  26.51 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.57 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2566  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.63 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.903324  normal  0.0772573 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0371  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  22.12 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1846  L-alanine-DL-glutamate epimerase/enolase superfamily-like protein  26.13 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1882  o-succinylbenzoic acid synthetase  26.13 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25190  O-succinylbenzoate synthase  28.88 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0433  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.82 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0951  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.14 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0386  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.82 
 
 
369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5011  N-acylamino acid racemase  24.04 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1393  o-succinylbenzoic acid (OSB) synthetase  26.52 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4992  N-acylamino acid racemase  24.39 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4981  N-acylamino acid racemase  24.51 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2140  mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  22.63 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4932  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  21.82 
 
 
369 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.318001  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2532  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  23.94 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2879  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  27.09 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00129652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  24.46 
 
 
955 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4584  enolase superfamily protein; N-acylamino acid racemase, mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, or o-succinylbenzoate synthase  24.48 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  24.87 
 
 
369 aa  67.4  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0404  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  22.71 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.125828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4964  N-acylamino acid racemase  24.55 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>