More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1180 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  100 
 
 
360 aa  734    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  66.39 
 
 
363 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  66.11 
 
 
363 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  64.72 
 
 
363 aa  488  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  64.72 
 
 
363 aa  488  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  63.6 
 
 
242 aa  316  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1740  ATPase  66.67 
 
 
235 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000485262  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  59 
 
 
244 aa  305  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1053  ABC transporter related  59.41 
 
 
242 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  60.67 
 
 
240 aa  300  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  55.6 
 
 
246 aa  298  1e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  56.49 
 
 
240 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0652  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  58.16 
 
 
244 aa  297  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.16 
 
 
240 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0849  ABC transporter related  55.65 
 
 
247 aa  296  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000288361  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  58.16 
 
 
240 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.04 
 
 
246 aa  295  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  58.58 
 
 
241 aa  295  9e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  56.9 
 
 
240 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  56.9 
 
 
242 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0494  glutamate/aspartate ABC transporter, ATP-binding protein  56.9 
 
 
242 aa  293  3e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  56.49 
 
 
240 aa  293  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1945  ABC transporter related  58.75 
 
 
242 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0428328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0492  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
244 aa  293  4e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1911  ABC transporter related  58.75 
 
 
242 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00547545  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0545  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  57.08 
 
 
244 aa  293  4e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000820774  unclonable  1.6133500000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  58.58 
 
 
241 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  58.58 
 
 
241 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 
251 aa  292  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  57.74 
 
 
241 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  58.58 
 
 
241 aa  290  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  55.23 
 
 
240 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1072  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 
240 aa  289  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.244358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3762  ABC transporter-related protein  57.32 
 
 
241 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000558421  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  57.74 
 
 
241 aa  288  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2298  ABC transporter related  57.14 
 
 
247 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  56.07 
 
 
241 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.46 
 
 
249 aa  288  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  56.07 
 
 
241 aa  288  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 
241 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  56.07 
 
 
241 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2289  ABC transporter related  54.81 
 
 
240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000025555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.81 
 
 
244 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6988  ABC transporter related  52.24 
 
 
265 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.741907  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  55.65 
 
 
241 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1231  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.07 
 
 
242 aa  286  4e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3404  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
240 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0452934  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  53.14 
 
 
244 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1387  ATPase  54.96 
 
 
243 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.212877  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  52.3 
 
 
257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2233  ABC transporter related  55.46 
 
 
246 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.693391  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0414  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
242 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3809  ABC transporter related  53.97 
 
 
240 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  56.07 
 
 
239 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1866  ABC transporter related protein  54.39 
 
 
242 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000046676  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  54.81 
 
 
244 aa  281  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1394  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.97 
 
 
240 aa  280  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2727  ABC transporter related  53.56 
 
 
243 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 
242 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.233716  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
246 aa  280  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  53.14 
 
 
245 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  54.2 
 
 
257 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  54.81 
 
 
241 aa  279  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0981  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.49 
 
 
242 aa  279  5e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0598  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
242 aa  279  5e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.17 
 
 
249 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  52.3 
 
 
244 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  53.14 
 
 
242 aa  278  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  53.56 
 
 
242 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  53.14 
 
 
253 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
253 aa  278  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  53.56 
 
 
244 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  54.92 
 
 
254 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  53.56 
 
 
242 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  52.72 
 
 
256 aa  277  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.79 
 
 
273 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  54.39 
 
 
245 aa  278  2e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3165  ABC transporter related  55.04 
 
 
257 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.127499  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0085  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55 
 
 
254 aa  277  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000203236  normal  0.523772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1820  ABC transporter related  55.79 
 
 
248 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.56 
 
 
284 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  54.81 
 
 
243 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2303  ABC transporter related protein  54.39 
 
 
246 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3911  ABC transporter  53.53 
 
 
244 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.357859  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  53.14 
 
 
240 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0741  ABC transporter related  56.25 
 
 
241 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  59.07 
 
 
242 aa  276  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
240 aa  276  4e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  54.2 
 
 
246 aa  276  4e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  53.36 
 
 
263 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  51.87 
 
 
247 aa  276  4e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2285  ABC transporter related  54.39 
 
 
248 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000014239 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0973  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.14 
 
 
240 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128228  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3964  ABC transporter related  51.88 
 
 
258 aa  276  5e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4332  ABC transporter related  51.88 
 
 
258 aa  276  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.282174 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1533  ABC transporter related  53.09 
 
 
246 aa  275  8e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534266  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1849  ABC transporter related  54.55 
 
 
251 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  53.82 
 
 
254 aa  275  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2847  ABC transporter-related protein  52.3 
 
 
240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174952  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0911  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.250049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>