188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0676 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0676  ribosomal protein L11  100 
 
 		 169 aa  337  4e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1832  50S ribosomal protein L11P  42.07 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0464  50S ribosomal protein L11P  43.03 
 
 		 167 aa  130  6.999999999999999e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1656  50S ribosomal protein L11P  40.24 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1602  50S ribosomal protein L11P  39.39 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.951942 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1317  ribosomal protein L11  38.46 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.820639  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0657  ribosomal protein L11  37.04 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000988866  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1634  50S ribosomal protein L11P  35.54 
 
 		 168 aa  94.4  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0552627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0412  ribosomal protein L11  32.1 
 
 		 158 aa  90.9  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.012811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0162  ribosomal protein L11  31.68 
 
 		 158 aa  90.9  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2252  ribosomal protein L11  31.71 
 
 		 158 aa  85.9  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000879561  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0744  50S ribosomal protein L11P  30.82 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.008339  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0385  50S ribosomal protein L11  32.91 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1582  50S ribosomal protein L11P  28.83 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000486455  hitchhiker  0.00593088 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0615  50S ribosomal protein L11P  29.52 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.853366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0252  50S ribosomal protein L11P  30.43 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2187  50S ribosomal protein L11P  29.01 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1514  ribosomal protein L11  29.63 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1945  50S ribosomal protein L11P  27.61 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000302762  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0224  ribosomal protein L11  31.88 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4459  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1422  ribosomal protein L11  31.68 
 
 		 159 aa  72  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3510  Ribosomal protein L11-like protein  28.22 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0145  50S ribosomal protein L11P  27.61 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.020771  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0863  Ribosomal protein L11-like protein  32.89 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1240  50S ribosomal protein L11P  26.99 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.211318  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1983  50S ribosomal protein L11P  27.61 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.138547 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0678  50S ribosomal protein L11P  26.99 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.407725 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1009  50S ribosomal protein L11P  29.01 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  27.46 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4481  ribosomal protein L11  27.97 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00539416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3453  50S ribosomal protein L11  26.57 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00121261  normal  0.0330426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  26.76 
 
 		 141 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  26.62 
 
 		 144 aa  50.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  28.47 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0387  ribosomal protein L11  30.23 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  33.72 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4116  50S ribosomal protein L11P  28.67 
 
 		 165 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  26.47 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3288  ribosomal protein L11  29.2 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0476152  normal  0.16054 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3326  50S ribosomal protein L11  28.47 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0847477  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  26.62 
 
 		 144 aa  49.3  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3173  50S ribosomal protein L11  27.97 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3864  50S ribosomal protein L11  26.96 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.094811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  30 
 
 		 143 aa  48.5  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0395  50S ribosomal protein L11  29.41 
 
 		 143 aa  48.1  0.00006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00763778  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5110  ribosomal protein L11  31.78 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0690827  normal  0.715797 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  25.18 
 
 		 142 aa  47.8  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  25.18 
 
 		 141 aa  47.8  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0642  50S ribosomal protein L11  28.86 
 
 		 144 aa  47.4  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.28286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  26.81 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  31.4 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  26.24 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  31.4 
 
 		 141 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  25.35 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1400  hypothetical protein  27.74 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0097  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000212022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0097  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460749  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0093  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8225099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0091  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000002609  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0092  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000361724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5209  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540287  unclonable  4.7275e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  24.63 
 
 		 140 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0097  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1419  50S ribosomal protein L11P  29.23 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000108032  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  30.23 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02331  50S ribosomal protein L11  28.26 
 
 		 141 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0117  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  26.47 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0091  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0308  50S ribosomal protein L11  26.81 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00601669  normal  0.0251359 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  30.12 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  28.26 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  28.26 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3472  50S ribosomal protein L11  26.09 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.275844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1823  50S ribosomal protein L11  30.95 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.135034  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6640  50S ribosomal protein L11  29.76 
 
 		 144 aa  44.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0206  50S ribosomal protein L11  31.03 
 
 		 141 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.530774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  25 
 
 		 141 aa  44.7  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1333  50S ribosomal protein L11  29.11 
 
 		 140 aa  44.3  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0880682 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  25.18 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  26.95 
 
 		 142 aa  44.3  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0390  50S ribosomal protein L11  23.94 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  25 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  30.68 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0920  50S ribosomal protein L11  24.64 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000795353  hitchhiker  0.00000174139 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1147  ribosomal protein L11  27.43 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372425  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0422  50S ribosomal protein L11  27.59 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000957396  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  25.36 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  26.62 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  25 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2953  ribosomal protein L11  25.55 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000073817  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1104  ribosomal protein L11  23.78 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0115912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1939  50S ribosomal protein L11  25.17 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5087  50S ribosomal protein L11  26.96 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0150529  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1667  50S ribosomal protein L11  27.43 
 
 		 140 aa  44.3  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00198224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4701  50S ribosomal protein L11  25 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000419074  hitchhiker  0.00000427936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3250  50S ribosomal protein L11  26.81 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>