More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1047 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1047  preprotein translocase subunit SecF  100 
 
 		 323 aa  643    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1235  preprotein translocase subunit SecF  73.37 
 
 		 323 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.178131  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1110  preprotein translocase subunit SecF  73.37 
 
 		 323 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0631  preprotein translocase subunit SecF  72.76 
 
 		 323 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0708  preprotein translocase subunit SecF  65.33 
 
 		 323 aa  448  1e-125  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0072  preprotein translocase subunit SecF  65.63 
 
 		 323 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0475  preprotein translocase subunit SecF  59.13 
 
 		 323 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0729  preprotein translocase subunit SecF  66.25 
 
 		 323 aa  380  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111579  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1620  protein-export membrane protein SecF  53.56 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1574  preprotein translocase subunit SecF  51.39 
 
 		 323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0273  preprotein translocase subunit SecF  43.61 
 
 		 315 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01049  preprotein translocase subunit SecF  43.61 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3517  preprotein translocase subunit SecF  43.4 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.943932  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3410  preprotein translocase subunit SecF  39.68 
 
 		 310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.470733  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1064  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204402 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004364  protein-export membrane protein SecF  42.95 
 
 		 315 aa  239  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0679828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1231  protein-export membrane protein SecF  40.38 
 
 		 313 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0866  preprotein translocase subunit SecF  42.66 
 
 		 302 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222243  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1231  preprotein translocase subunit SecF  41.26 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.611016  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0836  preprotein translocase subunit SecF  42.31 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1123  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0879  preprotein translocase subunit SecF  41.96 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0954141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1416  protein-export membrane protein SecF  40.91 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0878  preprotein translocase subunit SecF  37.82 
 
 		 323 aa  231  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0467  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0508  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0448  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0447  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0454  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01348  protein-export membrane protein SecF  40.52 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.256718  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3281  preprotein translocase subunit SecF  40.86 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0339451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2432  preprotein translocase subunit SecF  43.86 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1891  preprotein translocase subunit SecF  42.37 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000401903  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0511  preprotein translocase subunit SecF  39.31 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.956081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2426  preprotein translocase subunit SecF  39.3 
 
 		 310 aa  229  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2699  preprotein translocase subunit SecF  39.68 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.584759  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2080  preprotein translocase subunit SecF  38.91 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2056  protein-export membrane protein SecF  36.91 
 
 		 337 aa  228  9e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.880378  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1714  protein-export membrane protein SecF  36.91 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.611616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3110  preprotein translocase subunit SecF  39.42 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1404  preprotein translocase subunit SecF  39.87 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0316508  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1330  SecF protein  42.41 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0105179  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00357  protein export protein SecF  37.18 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.797763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3200  protein-export membrane protein SecF  37.18 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0111096  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0479  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0441  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0439  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00361  hypothetical protein  37.18 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0489  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0328  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.264814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3224  preprotein translocase subunit SecF  37.18 
 
 		 323 aa  226  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3381  preprotein translocase subunit SecF  37.91 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144101  normal  0.396634 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0600  protein-export membrane protein SecF  40.85 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3120  preprotein translocase subunit SecF  37.91 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0405125  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3261  preprotein translocase subunit SecF  37.91 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.578435  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2334  preprotein translocase subunit SecF  40.69 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4342  preprotein translocase subunit SecF  41.96 
 
 		 302 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.557524  hitchhiker  0.0000000544827 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1385  preprotein translocase subunit SecF  40.82 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00983524  hitchhiker  0.000000302266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1438  preprotein translocase subunit SecF  40.82 
 
 		 315 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0107161  hitchhiker  0.00000672809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2716  preprotein translocase subunit SecF  37.66 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3211  protein translocase subunit secF  43.69 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0684  preprotein translocase subunit SecF  38.61 
 
 		 309 aa  222  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.738953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1473  preprotein translocase subunit SecF  41.27 
 
 		 315 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.13163  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1450  preprotein translocase subunit SecF  40.51 
 
 		 315 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101016  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2211  preprotein translocase subunit SecF  40.38 
 
 		 314 aa  222  9e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433949  normal  0.220964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4618  preprotein translocase subunit SecF  41.26 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3993  preprotein translocase subunit SecF  36.86 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117459  normal  0.130054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0702  preprotein translocase subunit SecF  36.42 
 
 		 316 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.686375  normal  0.807805 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3094  preprotein translocase subunit SecF  38.11 
 
 		 323 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3374  preprotein translocase subunit SecF  37.74 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1275  preprotein translocase subunit SecF  37.74 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3365  preprotein translocase subunit SecF  37.74 
 
 		 316 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4086  preprotein translocase subunit SecF  39.4 
 
 		 321 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0605459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3331  preprotein translocase subunit SecF  37.74 
 
 		 316 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0935512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0837  preprotein translocase subunit SecF  37.01 
 
 		 316 aa  218  7.999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2065  preprotein translocase subunit SecF  41.67 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2384  preprotein translocase subunit SecF  37.42 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1981  preprotein translocase subunit SecF  44.37 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1976  preprotein translocase subunit SecF  44.37 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2811  preprotein translocase subunit SecF  37.26 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2570  preprotein translocase subunit SecF  37.42 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1162  preprotein translocase subunit SecF  37.42 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.954336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0300  preprotein translocase subunit SecF  37.42 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2903  preprotein translocase subunit SecF  38.11 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2879  preprotein translocase subunit SecF  38.61 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0152003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1302  protein-export membrane protein SecF  41.21 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2667  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452274  normal  0.524558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2784  preprotein translocase subunit SecF  38.61 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0481367  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0609  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 316 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2528  preprotein translocase subunit SecF  36.08 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2804  preprotein translocase subunit SecF  38.61 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00594045  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2481  preprotein translocase subunit SecF  39.56 
 
 		 315 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0456849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3807  preprotein translocase subunit SecF  37.42 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2550  preprotein translocase subunit SecF  37.81 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.341971  normal  0.338499 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2960  preprotein translocase subunit SecF  37.54 
 
 		 323 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0634  preprotein translocase subunit SecF  38.01 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0235  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0687  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0719  preprotein translocase subunit SecF  37.1 
 
 		 316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2644  protein-export membrane protein SecF  39.87 
 
 		 304 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0946476  hitchhiker  0.00035144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>