96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0976 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0976  putative permease, YjgP/YjgQ family  100 
 
 		 341 aa  668    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0843  hypothetical protein  58.19 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0913  hypothetical protein  58.19 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.17255  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1188  hypothetical protein  56.73 
 
 		 341 aa  381  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0525463  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0748  YjgP/YjgQ permease  49.13 
 
 		 341 aa  334  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0972  YjgP/YjgQ permease  50.74 
 
 		 340 aa  332  8e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.707138  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0698  ribonuclease PH  45.64 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.782296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1263  permease YjgP/YjgQ  44.19 
 
 		 342 aa  308  9e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000160031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1127  permease YjgP/YjgQ family protein  43.6 
 
 		 341 aa  232  9e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0995  permease YjgP/YjgQ  35.6 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  24.76 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  24.55 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  26.85 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  23.33 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  24.65 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  21.71 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  24.89 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  20.83 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  21.25 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  23.14 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  24.54 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.12 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  24.58 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  22.99 
 
 		 418 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  25.25 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  21.15 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  23.36 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  22.91 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  23.39 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  24.07 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.5 
 
 		 378 aa  53.9  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  21.99 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 391 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  21.04 
 
 		 373 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  24.02 
 
 		 388 aa  52.8  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  22.12 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1363  hypothetical protein  25.1 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  22.47 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 370 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 370 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2139  permease YjgP/YjgQ family protein  20.85 
 
 		 367 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  21.81 
 
 		 370 aa  49.7  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0925  permease YjgP/YjgQ family protein  22.36 
 
 		 370 aa  49.3  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000914337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  20.18 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  22.29 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  23.66 
 
 		 384 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  22.73 
 
 		 371 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  21.24 
 
 		 388 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  23.11 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  23.18 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  21.31 
 
 		 392 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  22.73 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  20.87 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  22.43 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1373  queuine tRNA-ribosyltransferase  24.74 
 
 		 360 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  19.5 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  23.5 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  20.99 
 
 		 369 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5783  putative permease  22.56 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000294674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  23.18 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04091  hypothetical protein  22.56 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000267736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4742  putative permease  22.56 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000002134  normal  0.891327 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3751  permease YjgP/YjgQ family protein  22.56 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000820962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4834  putaitve permease  22.56 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000998605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4517  putative permease  22.56 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  4.2463499999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04127  conserved inner membrane protein  22.56 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000245131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  22.83 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  31.58 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1225  permease YjgP/YjgQ family protein  27.54 
 
 		 365 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0443365  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  28.81 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  20.33 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.04 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  26.04 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  20.33 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0389  permease YjgP/YjgQ family protein  20.92 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00124488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2100  hypothetical protein  22.86 
 
 		 339 aa  43.5  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0377846  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  30.97 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  19.5 
 
 		 389 aa  43.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 		 373 aa  43.1  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  27.08 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  28.95 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  21.91 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  19.88 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4827  putative permease  24.1 
 
 		 366 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000984202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4883  permease  24.1 
 
 		 366 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00332815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4734  putative permease  24.1 
 
 		 366 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000385303  normal  0.325053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4764  putative permease  24.1 
 
 		 366 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000634787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4864  putative permease  24.1 
 
 		 366 aa  42.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000973807  normal  0.308777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>