150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2076 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2076  cytochrome c class I  100 
 
 
261 aa  522  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15700  cytochrome c, mono- and diheme variants family  75.48 
 
 
259 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.871134  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1447  cytochrome c class I  69.47 
 
 
284 aa  372  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0356963  normal  0.171198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1891  cytochrome c class I  68.2 
 
 
259 aa  355  5e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.527374  hitchhiker  0.000337472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2009  cytochrome c class I  72.8 
 
 
259 aa  324  9e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14180  cytochrome c, mono- and diheme variants family  59.7 
 
 
266 aa  296  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.616928  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2210  cytochrome c, class I  59.7 
 
 
262 aa  287  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0119453  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  56.06 
 
 
276 aa  277  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12130  cytochrome c, mono- and diheme variants family  62.84 
 
 
256 aa  276  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.298886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1947  cytochrome c class I  58.17 
 
 
262 aa  271  8.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000151337 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16190  cytochrome c, mono- and diheme variants family  54.17 
 
 
263 aa  269  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.188569  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1678  cytochrome c class I  54.04 
 
 
289 aa  268  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  54.34 
 
 
269 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0963  cytochrome c, class I  54.69 
 
 
268 aa  255  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0745087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3251  cytochrome c class I  57.45 
 
 
277 aa  254  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0775555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  51.65 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  50 
 
 
270 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  48.57 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  47.76 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3135  cytochrome c, class I  50.61 
 
 
289 aa  211  7.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  50.19 
 
 
272 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  50.19 
 
 
272 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  50.19 
 
 
272 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12222  ubiquinol-cytochrome C reductase qcrC (cytochrome C subunit)  46.83 
 
 
280 aa  205  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  46.96 
 
 
305 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3294  cytochrome c, class I  44.49 
 
 
277 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79873  normal  0.176806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3526  cytochrome c class I  45.2 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2955  cytochrome c, class I  48.37 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3558  cytochrome c, class I  47.62 
 
 
273 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0912153 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  38.74 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10680  cytochrome c, mono- and diheme variants family  45.8 
 
 
275 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0523281  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2693  cytochrome c class I  41.22 
 
 
306 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4119  cytochrome c class I  44.35 
 
 
271 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.83541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3134  cytochrome c class I  38.64 
 
 
311 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3056  cytochrome c class I  45.8 
 
 
295 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  45.58 
 
 
255 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  42.99 
 
 
280 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2545  putative cytochrome c  33.56 
 
 
350 aa  62.4  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.7 
 
 
293 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1820  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  32.79 
 
 
327 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.700431  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2041  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  29.02 
 
 
304 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112855  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.2 
 
 
308 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3819  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.15 
 
 
313 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.718495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.39 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.19 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1279  cytochrome C oxidase subunit III  28.04 
 
 
326 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.55862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2001  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.08 
 
 
325 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2070  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.51 
 
 
317 aa  53.1  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19980  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.79 
 
 
306 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.181448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.27 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  23.88 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.38 
 
 
308 aa  52.8  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1200  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.37 
 
 
307 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944048  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1824  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  28.57 
 
 
317 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3572  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.97 
 
 
313 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2038  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  26.6 
 
 
304 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1107  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.37 
 
 
307 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1867  normal  0.890058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3576  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.08 
 
 
326 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0327  cytochrome c class I  28.34 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4258  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.27 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.816603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3416  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  28.46 
 
 
325 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0781  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.86 
 
 
382 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279912  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1615  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.46 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0748863  normal  0.0271548 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2821  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.21 
 
 
303 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.97 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44400  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.97 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.56 
 
 
311 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3780  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  31.97 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.5 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.04222  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2009  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.65 
 
 
322 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0902386  hitchhiker  0.0000000272898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1966  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.65 
 
 
322 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00926304  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.05 
 
 
304 aa  50.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3823  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.27 
 
 
325 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85561  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0775  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit III  32.39 
 
 
374 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0709529  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5347  putative cytochrome c  25.23 
 
 
272 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118303  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2542  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.27 
 
 
294 aa  49.7  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.854548 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2110  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.65 
 
 
322 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0408813  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1610  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.46 
 
 
325 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00269268  hitchhiker  0.0066634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1933  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.11 
 
 
305 aa  48.9  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0570892  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2361  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  29.5 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2013  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  27.32 
 
 
324 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00187341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1794  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.66 
 
 
325 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.448855  normal  0.0580758 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4490  hypothetical protein  28.11 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2204  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.11 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000397613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.11 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000127298  normal  0.441817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2167  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.11 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  25.11 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2217  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.11 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106993  normal  0.268308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  30.26 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2253  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.09 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.168664  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44360  putative cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  33.7 
 
 
308 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.922379  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0957  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.31 
 
 
723 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.12457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  36.56 
 
 
878 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3776  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  33.7 
 
 
308 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1992  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.97 
 
 
323 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2422  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  26.2 
 
 
325 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000195931  hitchhiker  0.0000802746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0043  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.71 
 
 
575 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0084  Cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  25.68 
 
 
307 aa  46.2  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000832498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.85 
 
 
298 aa  46.2  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1956  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  28.1 
 
 
322 aa  46.2  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>