More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1249 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
557 aa  1067    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.69 
 
 
568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.1 
 
 
562 aa  342  7e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.22 
 
 
535 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.75 
 
 
545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 
624 aa  325  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.23 
 
 
552 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.76 
 
 
546 aa  324  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.65 
 
 
543 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.47 
 
 
543 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.47 
 
 
543 aa  311  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.29 
 
 
563 aa  310  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1009  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.65 
 
 
571 aa  283  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.752624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.95 
 
 
602 aa  270  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.8 
 
 
793 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.25 
 
 
1376 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.27 
 
 
556 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.63 
 
 
590 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1208  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.75 
 
 
515 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000154408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.96 
 
 
509 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.96 
 
 
509 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.68 
 
 
509 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.68 
 
 
509 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.72 
 
 
509 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.47 
 
 
509 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  30.75 
 
 
509 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.66 
 
 
630 aa  238  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.26 
 
 
509 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.18 
 
 
509 aa  236  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  39.94 
 
 
597 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.71 
 
 
605 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.55 
 
 
705 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.67 
 
 
588 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.55 
 
 
588 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.89 
 
 
625 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.77 
 
 
600 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  34.97 
 
 
724 aa  231  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.19 
 
 
611 aa  231  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.23 
 
 
594 aa  230  6e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.55 
 
 
633 aa  230  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.12 
 
 
691 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.4 
 
 
691 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.12 
 
 
691 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.87 
 
 
603 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.45 
 
 
708 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3334  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.3 
 
 
679 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.729539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.65 
 
 
691 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.26 
 
 
716 aa  228  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.51 
 
 
707 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
615 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.21 
 
 
598 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.3 
 
 
479 aa  227  4e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.77 
 
 
615 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.67 
 
 
609 aa  226  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.87 
 
 
617 aa  226  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.91 
 
 
709 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.48 
 
 
609 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.81 
 
 
754 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.73 
 
 
611 aa  225  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.73 
 
 
611 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.77 
 
 
615 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.77 
 
 
615 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.91 
 
 
709 aa  225  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.56 
 
 
615 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.73 
 
 
609 aa  225  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.73 
 
 
609 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.55 
 
 
714 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.12 
 
 
748 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.5 
 
 
607 aa  224  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.44 
 
 
611 aa  224  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
625 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  38.44 
 
 
611 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  42.23 
 
 
709 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2696  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.65 
 
 
718 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.820222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  38.44 
 
 
609 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.73 
 
 
609 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.5 
 
 
711 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.04 
 
 
646 aa  223  6e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.97 
 
 
607 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  36.08 
 
 
679 aa  223  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 
626 aa  223  8e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.68 
 
 
625 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.11 
 
 
715 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.64 
 
 
710 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.11 
 
 
715 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.8 
 
 
728 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.22 
 
 
712 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0416  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.91 
 
 
725 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.65575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.18 
 
 
599 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.52 
 
 
715 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.13 
 
 
674 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.38 
 
 
601 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.12 
 
 
602 aa  221  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 
715 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1895  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.71 
 
 
633 aa  220  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  42.81 
 
 
618 aa  220  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.87 
 
 
609 aa  219  7e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.34 
 
 
864 aa  219  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.14 
 
 
617 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.14 
 
 
619 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>