More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08580 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08580  A/G-specific DNA glycosylase  100 
 
 		 315 aa  657    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.210115 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1271  HhH-GPD family protein  55.9 
 
 		 291 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12880  A/G-specific DNA glycosylase  51.96 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0147608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0121  HhH-GPD family protein  48.56 
 
 		 333 aa  261  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000756832  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1613  A/G-specific adenine glycosylase, putative  46.59 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1654  HhH-GPD  45.52 
 
 		 285 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000331061  normal  0.759743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3486  HhH-GPD family protein  45.62 
 
 		 299 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2170  HhH-GPD family protein  44.69 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.837161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1721  HhH-GPD family protein  44.81 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1120  hypothetical protein  44.74 
 
 		 292 aa  220  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.613239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0985  HhH-GPD family protein  44.96 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000391323  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1219  HhH-GPD family protein  42.31 
 
 		 315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.421615  normal  0.326405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3218  HhH-GPD  42.64 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3189  HhH-GPD family protein  37.75 
 
 		 318 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1488  HhH-GPD family protein  36.91 
 
 		 278 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1137  HhH-GPD  36.93 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2917  HhH-GPD family protein  37.45 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1393  HhH-GPD family protein  34.16 
 
 		 278 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1020  HhH-GPD family protein  38.16 
 
 		 278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.425237  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  42.05 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1296  HhH-GPD family protein  39.62 
 
 		 222 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1520  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0971  HhH-GPD  36.71 
 
 		 285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1730  A/G-specific adenine glycosylase  37.37 
 
 		 383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.309429  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01570  A/G-specific adenine glycosylase  34.98 
 
 		 313 aa  128  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1792  A/G-specific adenine glycosylase  38.38 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0591785  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1607  A/G-specific adenine glycosylase  38.38 
 
 		 339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2531  HhH-GPD family protein  34.23 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0428971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  39.88 
 
 		 352 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5427  A/G-specific adenine glycosylase  40.72 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0901  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  42.27 
 
 		 357 aa  125  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  39.88 
 
 		 352 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1715  A/G-specific adenine glycosylase  37.69 
 
 		 374 aa  124  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000646411  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2939  HhH-GPD family protein  32.31 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.223861  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0830  A/G-specific adenine glycosylase  42.27 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19342  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1974  A/G-specific adenine glycosylase  37.89 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  40.8 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0394  HhH-GPD family protein  35.23 
 
 		 581 aa  122  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  39.56 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3282  HhH-GPD family protein  37.39 
 
 		 303 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.36301  hitchhiker  0.0043845 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  38.82 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2876  HhH-GPD family protein  43.65 
 
 		 272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0048727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03591  A/G-specific adenine glycosylase  42.14 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0960  hypothetical protein  39.01 
 
 		 355 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  37.5 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000137419  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.23 
 
 		 360 aa  119  7e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  39.02 
 
 		 382 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0534  A/G-specific adenine glycosylase  40.71 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000506444  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0131  A/G-specific adenine glycosylase  35.6 
 
 		 342 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002446  A/G-specific adenine glycosylase  41.43 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0492141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2002  HhH-GPD family protein  31.95 
 
 		 330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0546697  normal  0.289046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8366  HhH-GPD family protein  32.91 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0037  HhH-GPD family protein  33.76 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2875  HhH-GPD:Iron-sulfur cluster loop  32.09 
 
 		 291 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.738957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4400  HhH-GPD family protein  38.67 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0804  A/G-specific DNA glycosylase  39.08 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.591097 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  39.68 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0395  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.86 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.491407 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1861  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.68 
 
 		 342 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000833556  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1916  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 		 381 aa  115  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4708  HhH-GPD family protein  31.82 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.109375  normal  0.0140541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0064  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.43 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000461825  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0563  HhH-GPD family protein  51.15 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630244 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2826  A/G-specific adenine glycosylase  39.78 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0490  HhH-GPD family protein  34.05 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.270588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0003  A/G-specific adenine glycosylase  40.71 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000019513  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3604  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.7 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211751  hitchhiker  0.00640648 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4148  A/G-specific adenine glycosylase  35.63 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3686  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.899508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1171  putative A/G-specific adenine glycosylase  32.39 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0418958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2201  HhH-GPD family protein  31.27 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  34.19 
 
 		 396 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0270  HhH-GPD family protein  38.76 
 
 		 353 aa  113  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4274  HhH-GPD family protein  31.12 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.162627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  45.74 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2267  A/G-specific adenine glycosylase MutY  43.48 
 
 		 354 aa  112  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  40.56 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000558564  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3362  A/G-specific adenine glycosylase  37.65 
 
 		 350 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000558357  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2097  HhH-GPD family protein  40.23 
 
 		 328 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.291413 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1621  A/G-specific adenine glycosylase  44.06 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.865832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5983  A/G-specific adenine glycosylase  41.22 
 
 		 362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.868735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4339  A/G-specific adenine glycosylase  37.85 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00948332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3026  adenine DNA glycosylase  44.53 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  35.59 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  39.47 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2195  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.04 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.591242 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  36.57 
 
 		 368 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  42.97 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0905  A/G-specific adenine glycosylase  36.46 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0755  A/G-specific adenine glycosylase  42.64 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0010  A/G-specific adenine glycosylase  42.86 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13060  A/G-specific DNA glycosylase  34.07 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0610842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  36.31 
 
 		 365 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000718891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  43.61 
 
 		 368 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1984  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.55 
 
 		 453 aa  109  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.328101  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3206  adenine DNA glycosylase  44.19 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141745  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  43.61 
 
 		 368 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  37.08 
 
 		 364 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>