More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2342 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2342  ABC transporter related  100 
 
 		 783 aa  1602    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  36.36 
 
 		 850 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4722  excinuclease ABC, A subunit  36.35 
 
 		 861 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286456  normal  0.774067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1327  ABC transporter related  35.85 
 
 		 751 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2496  excinuclease ABC, A subunit  34.97 
 
 		 838 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0838  excinuclease ABC, A subunit  34.81 
 
 		 844 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503748  normal  0.281681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6072  ABC transporter related  33.17 
 
 		 827 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1801  ABC transporter related  36.94 
 
 		 745 aa  449  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.344909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3087  excinuclease ABC subunit A  34.75 
 
 		 838 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3139  excinuclease ABC subunit A  34.13 
 
 		 877 aa  452  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2636  excinuclease ABC, A subunit  34.37 
 
 		 838 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0906  excinuclease ABC, A subunit  34.16 
 
 		 860 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6311  excinuclease ABC, A subunit  33.77 
 
 		 843 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.420844  normal  0.88955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3531  ABC transporter related  36.49 
 
 		 754 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0491  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 794 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544871  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0329  excinuclease ABC subunit A  39.01 
 
 		 939 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0337  excinuclease ABC subunit A  38.86 
 
 		 939 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  32.99 
 
 		 897 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2348  ABC transporter-like protein  35.5 
 
 		 790 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.86691  normal  0.591253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03329  putative excinuclease ABC subunit A  34.09 
 
 		 834 aa  442  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0866  excinuclease ABC, A subunit  34.8 
 
 		 853 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.249589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  40.47 
 
 		 927 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1980  ABC transporter related  36.84 
 
 		 753 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0594  ABC transporter related  34.17 
 
 		 848 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.43104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0120  excinuclease ABC subunit A  41.46 
 
 		 948 aa  437  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.973474  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1904  excinuclease ABC, A subunit  34.34 
 
 		 843 aa  438  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000110525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2761  ABC transporter related protein  35.5 
 
 		 752 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0108  ABC transporter related  34.8 
 
 		 796 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1716  ABC transporter related  35.72 
 
 		 745 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0603  ABC transporter related  34 
 
 		 848 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100941  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3664  excinuclease ABC, A subunit  36.02 
 
 		 832 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19620  excinuclease ABC, A subunit  34.2 
 
 		 863 aa  439  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2679  ABC transporter related  34.55 
 
 		 795 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.249669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0616  ABC transporter related  34 
 
 		 848 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  33.03 
 
 		 2017 aa  434  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  32.81 
 
 		 950 aa  436  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  32.32 
 
 		 899 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1839  excinuclease ABC, A subunit  34.96 
 
 		 822 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.351475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3212  ABC transporter related protein  35.13 
 
 		 790 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125335  hitchhiker  0.000000125221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1659  ABC transporter related protein  34.51 
 
 		 792 aa  436  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.818321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5845  ABC transporter related  34.99 
 
 		 790 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3006  ABC transporter-related protein  34.75 
 
 		 792 aa  436  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320548  normal  0.524557 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4737  excinuclease ABC, A subunit  35.51 
 
 		 881 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2265  ABC transporter related  34.12 
 
 		 820 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.285501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2778  excinuclease ABC, A subunit  34.87 
 
 		 838 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0742019  normal  0.349743 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01950  Excinuclease ATPase subunit  35.69 
 
 		 798 aa  431  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2501  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 805 aa  430  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0521  excinuclease ABC, A subunit  37.29 
 
 		 948 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.276548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0097  ABC transporter related  35.25 
 
 		 792 aa  429  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73348  normal  0.128909 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1109  excinuclease ABC subunit A  36.96 
 
 		 947 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.57709  normal  0.229428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2085  excinuclease ABC, A subunit  34.99 
 
 		 851 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.56515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2123  excinuclease ABC, A subunit  33.52 
 
 		 944 aa  432  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429692 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10450  Excinuclease ABC subunit A  37.74 
 
 		 960 aa  431  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0436929  hitchhiker  0.0000000651145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0151  ABC transporter related  32.73 
 
 		 898 aa  427  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.160582 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0207  ABC transporter related  32.73 
 
 		 898 aa  427  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.328362  normal  0.710281 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1703  excinuclease ABC subunit A  38.78 
 
 		 949 aa  427  1e-118  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  37.65 
 
 		 942 aa  429  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2199  ABC transporter related  34.91 
 
 		 794 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.424891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0951  ABC transporter related  34.85 
 
 		 833 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.321909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2478  ABC transporter related  35 
 
 		 797 aa  429  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.704947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  39.27 
 
 		 947 aa  427  1e-118  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  38.05 
 
 		 946 aa  425  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1474  ABC transporter related  35.58 
 
 		 758 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.891231  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4831  excinuclease ABC subunit A  37.81 
 
 		 978 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  40.15 
 
 		 916 aa  425  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  38.08 
 
 		 971 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  38.19 
 
 		 944 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3727  ABC transporter related  34.27 
 
 		 810 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3174  excinuclease ABC subunit A  37.7 
 
 		 955 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3137  excinuclease ABC, A subunit  35.9 
 
 		 961 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.484359  normal  0.0493947 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  37.9 
 
 		 946 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0374  excinuclease ABC subunit A  38.15 
 
 		 952 aa  423  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1999  excinuclease ABC subunit A  36.7 
 
 		 946 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0576024  normal  0.88061 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0384  excinuclease ABC subunit A  35.4 
 
 		 954 aa  426  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000942847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  38.9 
 
 		 941 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2074  ABC transporter related  33.94 
 
 		 798 aa  422  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.012346  normal  0.112929 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1834  excinuclease ABC, A subunit  39.18 
 
 		 941 aa  419  1e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2038  excinuclease ABC, A subunit  37.3 
 
 		 963 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225095  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2026  ABC transporter related  33.78 
 
 		 818 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1452  excinuclease ABC, A subunit  33.14 
 
 		 833 aa  421  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28420  Excinuclease ATPase subunit  33.94 
 
 		 799 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1518  ABC transporter related  34.72 
 
 		 823 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.168965 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1525  excinuclease ABC subunit A  37.23 
 
 		 925 aa  421  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000267289  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0168  excinuclease ABC subunit A  39.88 
 
 		 921 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6204  nogalamycin resistance protein SnorO  34.5 
 
 		 750 aa  422  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.846667 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3111  excinuclease ABC subunit A  36.38 
 
 		 987 aa  419  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400929  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  39.85 
 
 		 916 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  35.92 
 
 		 920 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5040  excinuclease ABC, A subunit  37.7 
 
 		 971 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1893  excinuclease ABC, A subunit  38.48 
 
 		 945 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0808708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  37.12 
 
 		 954 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0866  excinuclease ABC subunit A  38.48 
 
 		 950 aa  421  1e-116  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0554  excinuclease ABC, A subunit  34.73 
 
 		 938 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0831  excinuclease ABC, A subunit  36.9 
 
 		 948 aa  419  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0795854  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  38.18 
 
 		 1008 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  37.52 
 
 		 957 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1160  excinuclease ABC, A subunit  37.88 
 
 		 953 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0264  ABC transporter related  34.49 
 
 		 761 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0816  excinuclease ABC, A subunit  41.61 
 
 		 983 aa  419  9.999999999999999e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0311  excinuclease ABC subunit A  39.24 
 
 		 942 aa  419  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00463978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>