More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5082 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  100 
 
 		 402 aa  811    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  42.56 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  35.62 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  31.04 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  29.46 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  28.92 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  28.35 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  31.29 
 
 		 372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  31.06 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  30.06 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  28.17 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  29.89 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  30.4 
 
 		 381 aa  113  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3782  aminotransferase class V  31.15 
 
 		 384 aa  112  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  30.67 
 
 		 389 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  27.35 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  30.05 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  26.61 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  28.93 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  29.9 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  29.64 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  27.84 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  25 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  29.33 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4802  aminotransferase class V  28.57 
 
 		 391 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  26.5 
 
 		 377 aa  95.5  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  28.88 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  27.17 
 
 		 377 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.8 
 
 		 412 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  24.68 
 
 		 380 aa  93.6  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.87 
 
 		 413 aa  92.8  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.87 
 
 		 413 aa  92.8  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  26.98 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  30.86 
 
 		 379 aa  92.8  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  27.49 
 
 		 377 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  24.28 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  26.42 
 
 		 391 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  27.37 
 
 		 377 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  28.42 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  26.15 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2336  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.22 
 
 		 435 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.828775 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3922  aminotransferase class V  26.75 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  26.38 
 
 		 401 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.1 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  28.97 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.28 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1695  aminotransferase class V  32.93 
 
 		 492 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1729  cysteine desulfurase family protein  28.17 
 
 		 385 aa  88.2  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000242055  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.23 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5190  aminotransferase class V  33.33 
 
 		 492 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  28.9 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1038  cysteine desulfurase family protein  26.34 
 
 		 382 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000028217  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2744  hypothetical protein  32.16 
 
 		 492 aa  86.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.22 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4091  aminotransferase class V  31.66 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  24.85 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1444  cysteine desulfurase IscS  31.67 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0139838 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  23.16 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2248  cysteine desulfurase, SufS subfamily  26.28 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0748033  normal  0.0430442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 400 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  25 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0616  aminotransferase class V  36.05 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  0.0437001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.93 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2502  cysteine desulfurase  31.14 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893038  normal  0.0261535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2386  cysteine desulfurase  31.14 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000240874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1932  cysteine desulfurase family protein  26.97 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4740  aminotransferase, class V  31.66 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.299118  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5203  aminotransferase, class V  31.66 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00405553  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2002  aminotransferase class V  32.52 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.611456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3426  aminotransferase, class V  31.66 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2971  cysteine desulfurase family protein  26.76 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000129059  hitchhiker  0.0000905656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4630  kynureninase  33.19 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0472348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1961  cysteine desulfurase  33.71 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.037165  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0484  aminotransferase class V  27.93 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2397  cysteine desulfurase  30.7 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0798953  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  25.47 
 
 		 880 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  26.76 
 
 		 382 aa  83.2  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3365  aminotransferase class V  31.16 
 
 		 494 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  31.86 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2424  cysteine desulfurase  30.26 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  30.81 
 
 		 388 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2149  cysteine desulfurase  30.7 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00291634  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2848  aminotransferase, class V  32.17 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  28.53 
 
 		 376 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1739  cysteine desulfurase  30.7 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1819  cysteine desulfurase  30.7 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00929317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  25.88 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  25.51 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2280  cysteine desulfurase  30.7 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0344556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  28.02 
 
 		 394 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0534  aminotransferase class V  32.39 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0386  cysteine desulfurase, SufS family protein  28.77 
 
 		 452 aa  81.6  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.559739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  27.88 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1569  cysteine desulfurase IscS  32.68 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.647921  normal  0.752048 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  25.29 
 
 		 407 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2264  cysteine desulfurase  30.26 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1295  aminotransferase class V  30.46 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  27.69 
 
 		 896 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0669  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.26 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.700717  normal  0.366803 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  24.68 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>