68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4772 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4772  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  320  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5272  hypothetical protein  55 
 
 
161 aa  184  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271323  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33580  hypothetical protein  43.4 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7386  hypothetical protein  43.65 
 
 
173 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.280707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0206  hypothetical protein  44.57 
 
 
158 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0880357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2695  hypothetical protein  31.9 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330247  normal  0.0941435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0568  hypothetical protein  34.53 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.119864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0917  hypothetical protein  30.34 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1502  hypothetical protein  27.88 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4968  hypothetical protein  33.6 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1342  hypothetical protein  37.36 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0252295  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3315  hypothetical protein  27.89 
 
 
161 aa  60.8  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3683  hypothetical protein  38.46 
 
 
141 aa  60.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0218781  normal  0.0754722 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2461  hypothetical protein  34 
 
 
150 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.958192  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0885  hypothetical protein  35.48 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5186  hypothetical protein  42.47 
 
 
107 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1038  hypothetical protein  35.48 
 
 
149 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3123  hypothetical protein  33.63 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2004  hypothetical protein  31.43 
 
 
127 aa  57.4  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal  0.327416 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2530  hypothetical protein  34.78 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1901  hypothetical protein  34.78 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1793  hypothetical protein  34.78 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0459  hypothetical protein  36.05 
 
 
165 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181647  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3735  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2273  hypothetical protein  43.86 
 
 
62 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0784666  hitchhiker  0.00253392 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6457  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599835  normal  0.0761371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3540  hypothetical protein  39.76 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000265  hypothetical protein  21.67 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5423  hypothetical protein  33.6 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.493242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2341  hypothetical protein  31.4 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.586477  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1396  hypothetical protein  42.11 
 
 
108 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.293362 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5009  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6279  hypothetical protein  29.82 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207499  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21790  hypothetical protein  28.8 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.676634  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5332  hypothetical protein  31.43 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486943  normal  0.0360239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3576  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0205  hypothetical protein  28.95 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1639  hypothetical protein  33.33 
 
 
166 aa  47.8  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3790  hypothetical protein  34.15 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3770  hypothetical protein  29.41 
 
 
160 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6616  hypothetical protein  30.48 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0545  hypothetical protein  35.21 
 
 
135 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.336103  normal  0.0525174 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5990  hypothetical protein  31.43 
 
 
151 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0530  hypothetical protein  35.21 
 
 
135 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.382149 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05635  hypothetical protein  20.83 
 
 
150 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2981  hypothetical protein  36.62 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.789055  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6688  hypothetical protein  30.48 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5845  hypothetical protein  30.48 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5746  hypothetical protein  30.48 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.360533  normal  0.553676 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6212  hypothetical protein  30.48 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619591 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4212  hypothetical protein  27.48 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00102749  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3246  hypothetical protein  35.21 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2186  hypothetical protein  30.83 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2092  hypothetical protein  30.83 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2078  hypothetical protein  30.12 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2433  hypothetical protein  32.14 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2977  hypothetical protein  28.17 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.250173  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2801  hypothetical protein  30.38 
 
 
104 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3262  hypothetical protein  29.03 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190468  normal  0.461905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4183  hypothetical protein  40.35 
 
 
109 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1750  hypothetical protein  30 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2141  hypothetical protein  26.61 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3861  hypothetical protein  23.93 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000667493  normal  0.500407 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2069  hypothetical protein  31.58 
 
 
107 aa  41.6  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.473334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0493  hypothetical protein  30.77 
 
 
146 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5233  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3448  hypothetical protein  29.58 
 
 
140 aa  40.8  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000390264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0372  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  40.4  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.362008  hitchhiker  0.00728634 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>