126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3561 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  100 
 
 
522 aa  1064    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  54.19 
 
 
532 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  51.86 
 
 
524 aa  521  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  42.35 
 
 
537 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  43.08 
 
 
526 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  42.08 
 
 
524 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  42.56 
 
 
522 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  42.64 
 
 
524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  43.41 
 
 
514 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  40.24 
 
 
518 aa  401  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  40.96 
 
 
513 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  39.54 
 
 
520 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  42.83 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  40.96 
 
 
513 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  40 
 
 
524 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  40.85 
 
 
513 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  45.91 
 
 
513 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  39.22 
 
 
514 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  40.5 
 
 
508 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  38.62 
 
 
543 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  38.62 
 
 
543 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  38.43 
 
 
543 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  39.66 
 
 
517 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  38.43 
 
 
543 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  40.19 
 
 
508 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  38.52 
 
 
525 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  39.89 
 
 
508 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  38.12 
 
 
528 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  43.22 
 
 
505 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  39.41 
 
 
531 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  40.35 
 
 
508 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  39.42 
 
 
507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  39.03 
 
 
507 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  36.97 
 
 
517 aa  350  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  38.02 
 
 
507 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  38.06 
 
 
507 aa  342  8e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  36.02 
 
 
515 aa  334  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  36.9 
 
 
511 aa  333  5e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  39.23 
 
 
507 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  37.87 
 
 
510 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  36.26 
 
 
520 aa  317  5e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  37.52 
 
 
537 aa  293  4e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  32.82 
 
 
508 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  40.09 
 
 
515 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  33.01 
 
 
505 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  33.01 
 
 
508 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  35.63 
 
 
499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  37.25 
 
 
497 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  35.44 
 
 
499 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  35.25 
 
 
499 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  34.3 
 
 
538 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  33.72 
 
 
538 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  36.82 
 
 
501 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  33.97 
 
 
538 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.48 
 
 
529 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  33.91 
 
 
538 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.48 
 
 
529 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  33.72 
 
 
538 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  33.72 
 
 
538 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  39.26 
 
 
505 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  41.73 
 
 
501 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  34.47 
 
 
507 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  39.95 
 
 
507 aa  260  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  37.45 
 
 
506 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  38.69 
 
 
501 aa  260  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  36.9 
 
 
503 aa  258  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  41.01 
 
 
501 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.73 
 
 
537 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  37.38 
 
 
505 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02202  tryptophan halogenase  35.62 
 
 
497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  34.6 
 
 
509 aa  255  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  37.14 
 
 
518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  32.01 
 
 
502 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  35.14 
 
 
500 aa  253  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2030  tryptophan halogenase  33.33 
 
 
497 aa  252  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  33.79 
 
 
506 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  32.62 
 
 
510 aa  249  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  40.19 
 
 
510 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  33.14 
 
 
504 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  33.59 
 
 
496 aa  247  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  33.14 
 
 
492 aa  246  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.35 
 
 
494 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  38.71 
 
 
504 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  34.17 
 
 
502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2208  tryptophan halogenase  35.86 
 
 
502 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0422503  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  36.98 
 
 
498 aa  243  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  34.23 
 
 
504 aa  243  9e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  31.71 
 
 
496 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2828  tryptophan halogenase  32.43 
 
 
498 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000300055  hitchhiker  0.0040734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  35.28 
 
 
505 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1309  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
495 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  38.52 
 
 
502 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  34.37 
 
 
496 aa  239  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  33.78 
 
 
503 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  33.78 
 
 
503 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  33.59 
 
 
503 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  33.4 
 
 
503 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02802  tryptophan halogenase  34.97 
 
 
523 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  31.97 
 
 
497 aa  236  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  31.58 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>