More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2858 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2858  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 383 aa  781    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0573433  normal  0.104932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  26.04 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  29.25 
 
 		 333 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 333 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2718  AraC family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3547  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16370  Transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 338 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0657  AraC family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4504  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 400 aa  99  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0682247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5976  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6649  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 339 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.0354217 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0902  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 358 aa  97.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3897  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5762  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5344  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 334 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025482  normal  0.1179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4663  helix-turn-helix domain-containing protein  28.23 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 353 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  33.01 
 
 		 353 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6705  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 334 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3167  helix-turn-helix domain-containing protein  26.48 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5670  transcriptional regulator, AraC family  27.33 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.661826  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4938  AraC family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6507  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 344 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739448  normal  0.944873 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0246  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 336 aa  90.1  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 398 aa  89.7  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31480  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 361 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.263324  hitchhiker  0.0000037216 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6223  transcriptional regulator, AraC family  25.44 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5125  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 353 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.506358  normal  0.385561 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6229  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662728  normal  0.031782 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1602  AraC family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2361  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5362  AraC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 348 aa  86.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  0.226827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 353 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3372  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5728  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 334 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2544  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5444  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6814  AraC family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 352 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5513  putative AraC family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3351  AraC family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530568  normal  0.830085 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4381  transcriptional regulator, AraC family  27.46 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5630  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.389433  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5781  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.436402 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5972  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0382965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2680  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0847825  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2071  helix-turn-helix domain-containing protein  26.05 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5546  AraC family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6762  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6273  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.294899  normal  0.494705 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4256  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.933319  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1556  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.728217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4356  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5651  transcriptional regulator, AraC family  24.78 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  27.74 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0743  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 330 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0242  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3659  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356023  normal  0.158074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0747  transcriptional regulator, AraC family  23.46 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.40849  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  29.53 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5509  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1836  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 340 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1083  AraC family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0148989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3102  helix-turn-helix, AraC type  26.76 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110134 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5098  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109281  normal  0.521536 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2376  transcriptional regulator, AraC family  23.71 
 
 		 359 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63280  putative transcriptional regulator  29.39 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0263362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6030  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5787  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  27.86 
 
 		 343 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0769  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.93872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0588  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0563  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1607  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1280  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.388416  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7688  transcriptional regulatory protein  26.89 
 
 		 338 aa  76.6  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3046  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3765  AraC family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1503  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.369518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  31.66 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2141  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0381  AraC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  31.41 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 343 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2871  AraC family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.176885  normal  0.124684 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2365  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000370263  hitchhiker  0.0000237936 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1473  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6754  AraC family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.527518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>