More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2645 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2645  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 373 aa  734    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.843824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2746  ThiJ/PfpI family protein  44.41 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.65 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4743  ThiJ/PfpI  44.34 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3423  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.34 
 
 		 366 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2944  ThiJ/PfpI  38.59 
 
 		 378 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.245807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2320  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.46 
 
 		 372 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4364  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.55 
 
 		 403 aa  222  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3893  ThiJ/PfpI domain protein  38.61 
 
 		 385 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2400  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.39 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4645  ThiJ/PfpI domain protein  32.01 
 
 		 492 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  36.03 
 
 		 202 aa  93.2  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  33.33 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  39.52 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.06 
 
 		 199 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 198 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  36.81 
 
 		 314 aa  86.3  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  31.55 
 
 		 254 aa  86.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 312 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.59 
 
 		 199 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  28.27 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  27.75 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 317 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  41.49 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  28.11 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  34.11 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.22 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4063  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.09 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4181  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.09 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  39.22 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 198 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  30.77 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  35.82 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.63 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 331 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  29.03 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  26.88 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  39.22 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  36.92 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.69 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.58 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  34.75 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.53 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  30.7 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  30.71 
 
 		 198 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 198 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.14 
 
 		 198 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  31.52 
 
 		 208 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  37.62 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.85 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33.33 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  39.18 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  32.94 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.94 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  26.19 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  33.61 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  31.07 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>