More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0587 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  100 
 
 		 680 aa  1368    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  56.93 
 
 		 617 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0566  dehydrogenase E1 component  55.09 
 
 		 666 aa  607  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  37.29 
 
 		 669 aa  349  9e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3081  dehydrogenase, E1 component  36.48 
 
 		 675 aa  347  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0845423  normal  0.132557 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  35.29 
 
 		 657 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  30.74 
 
 		 791 aa  331  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  34.06 
 
 		 678 aa  316  9.999999999999999e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0032  acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit, putative  33.9 
 
 		 729 aa  302  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2114  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  32.77 
 
 		 726 aa  300  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0490286  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0029  putative acetoin dehydrogenase, alpha/beta subunit  33.62 
 
 		 729 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0851607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4454  dehydrogenase, E1 component  32.52 
 
 		 726 aa  297  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  34.33 
 
 		 710 aa  294  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  31.26 
 
 		 659 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3319  Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)  32.39 
 
 		 724 aa  290  8e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0163319  hitchhiker  0.00280093 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2782  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta subunit  30.34 
 
 		 727 aa  290  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.653166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1571  dehydrogenase E1 component  34.59 
 
 		 728 aa  281  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2793  pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring) E1 component, alpha subunit  33.28 
 
 		 702 aa  281  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3824  dehydrogenase E1 component  30.5 
 
 		 659 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.200241  normal  0.786023 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0582  dehydrogenase E1 component  33.04 
 
 		 714 aa  278  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2840  dehydrogenase, E1 component  29.87 
 
 		 658 aa  271  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479964  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  30.84 
 
 		 736 aa  270  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  29.44 
 
 		 659 aa  270  8e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1039  transketolase, central region  46.5 
 
 		 324 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0489701  normal  0.0714055 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  29.54 
 
 		 668 aa  265  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0856  putative 2-oxo acid dehydrogenase beta subunit  46.44 
 
 		 324 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.389429  normal  0.709595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2034  transketolase domain protein  45.91 
 
 		 324 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2104  Transketolase central region  45.91 
 
 		 324 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.216578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2062  Transketolase domain protein  42.95 
 
 		 327 aa  259  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.258257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1826  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  45.6 
 
 		 324 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0449  transketolase domain-containing protein  44.72 
 
 		 325 aa  257  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.94075  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  45.28 
 
 		 324 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  46.54 
 
 		 326 aa  252  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3038  transketolase central region  43.63 
 
 		 325 aa  251  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  46.94 
 
 		 327 aa  249  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2811  Transketolase central region  45.54 
 
 		 326 aa  249  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3771  Transketolase central region  41.38 
 
 		 327 aa  249  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0028  Transketolase central region  41.38 
 
 		 327 aa  249  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1092  transketolase, central region  44.89 
 
 		 325 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1109  transketolase, central region  44.89 
 
 		 325 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1120  transketolase, central region  44.89 
 
 		 325 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  43.53 
 
 		 328 aa  247  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0840  transketolase, central region  42.01 
 
 		 327 aa  247  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.272287 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3596  Transketolase central region  42.72 
 
 		 342 aa  247  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  42.63 
 
 		 320 aa  247  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4082  Transketolase central region  41.75 
 
 		 335 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  42.86 
 
 		 327 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2364  Transketolase central region  40.74 
 
 		 324 aa  244  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2032  transketolase, central region  41.25 
 
 		 320 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  42.68 
 
 		 325 aa  243  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  30.81 
 
 		 692 aa  242  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1667  Transketolase central region  41.51 
 
 		 336 aa  242  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0349  transketolase, central region  41.8 
 
 		 330 aa  240  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0164413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  31.73 
 
 		 693 aa  239  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4116  transketolase central region  44.06 
 
 		 332 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3767  Transketolase domain protein  42.52 
 
 		 343 aa  239  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0091  Transketolase central region  41.72 
 
 		 324 aa  239  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2304  Transketolase central region  40.63 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2436  dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  41.64 
 
 		 328 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0108  transketolase central region  41.61 
 
 		 329 aa  238  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741994  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1434  transketolase  42.63 
 
 		 326 aa  237  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3331  transketolase central region  41.82 
 
 		 324 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.438418 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  44.55 
 
 		 326 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  43.57 
 
 		 324 aa  236  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0704  Transketolase central region  27.78 
 
 		 823 aa  236  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1966  Transketolase central region  43.83 
 
 		 326 aa  236  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1516  Transketolase central region  42.5 
 
 		 332 aa  236  8e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2251  Transketolase central region  38.96 
 
 		 328 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00217042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1973  Transketolase central region  39.26 
 
 		 328 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1851  Transketolase central region  41.43 
 
 		 335 aa  235  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.60983  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  43.42 
 
 		 327 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  40.98 
 
 		 339 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0762  transketolase domain-containing protein  30.84 
 
 		 692 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0266  Transketolase central region  40 
 
 		 327 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3932  Transketolase central region  48.28 
 
 		 336 aa  235  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3602  pyruvate dehydrogenase complex, E1 beta2 component  42.77 
 
 		 334 aa  234  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0108  transketolase, central region  41.3 
 
 		 329 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0456  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  39.58 
 
 		 337 aa  234  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04530  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dehydrogenase component beta subunit  40.69 
 
 		 344 aa  234  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0140  Transketolase central region  41.19 
 
 		 328 aa  234  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0525  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, beta subunit  39.58 
 
 		 337 aa  233  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4133  putative puryvate dehydrogenase E1 component subunit beta  43.08 
 
 		 326 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0398811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20360  precursor of dehydrogenase pyruvate dehydrogenase E1, alpha and beta subunits  26.58 
 
 		 814 aa  233  1e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.387314  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  42.38 
 
 		 330 aa  232  1e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05225  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  27.14 
 
 		 688 aa  232  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.737912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1616  Transketolase central region  41.96 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0824016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4977  transketolase, central region:transketolase, C-terminal  43.22 
 
 		 325 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0318  transketolase, central region  40.36 
 
 		 336 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.726078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4857  Transketolase central region  41.32 
 
 		 326 aa  231  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2827  transketolase central region  42.09 
 
 		 337 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2229  transketolase, central region  44.24 
 
 		 335 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  42.68 
 
 		 322 aa  231  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1028  transketolase, central region  39.94 
 
 		 333 aa  230  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1025  transketolase, central region  39.94 
 
 		 333 aa  230  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0434386  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  41.93 
 
 		 326 aa  230  7e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  41.59 
 
 		 341 aa  230  7e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2467  Transketolase central region  38.77 
 
 		 342 aa  230  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.773321  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  42.49 
 
 		 332 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46160  pyruvate dehydrogenase E1 beta subunit  45.62 
 
 		 323 aa  229  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.6913  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  31.44 
 
 		 709 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>