126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0296 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0296  tryptophan halogenase  100 
 
 
524 aa  1074    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.628963  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0297  tryptophan halogenase  66.73 
 
 
532 aa  728    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.427874  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3561  tryptophan halogenase  51.86 
 
 
522 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1023  putative tryptophan halogenase  43.71 
 
 
518 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2391  tryptophan halogenase, putative  43.1 
 
 
526 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000100477 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2406  tryptophan halogenase  45.26 
 
 
514 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.699378  normal  0.260972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3837  tryptophan halogenase  43.18 
 
 
524 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3217  tryptophan halogenase  42.58 
 
 
513 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1138  tryptophan halogenase  42.5 
 
 
513 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.443296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1078  tryptophan halogenase  42.39 
 
 
513 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0239  putative tryptophan halogenase  40.93 
 
 
537 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3053  tryptophan halogenase, putative  41.96 
 
 
508 aa  421  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03900  putative tryptophan halogenase  40 
 
 
522 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1312  tryptophan halogenase  41.71 
 
 
525 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1262  tryptophan halogenase, putative  40.78 
 
 
524 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.69859  hitchhiker  0.00000259242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2546  tryptophan halogenase  42 
 
 
517 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1209  tryptophan halogenase  42.38 
 
 
508 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.311625  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1022  putative tryptophan halogenase  41.17 
 
 
524 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3699  putative tryptophan halogenase  39.81 
 
 
514 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3685  tryptophan halogenase  41.34 
 
 
527 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3023  tryptophan halogenase  41.63 
 
 
507 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.172651  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1172  tryptophan halogenase  41.47 
 
 
507 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.146451  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1124  tryptophan halogenase  40.11 
 
 
543 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1113  tryptophan halogenase  42.09 
 
 
508 aa  403  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1179  tryptophan halogenase  39.55 
 
 
543 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1098  tryptophan halogenase  41.92 
 
 
508 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3513  tryptophan halogenase, putative  39.88 
 
 
507 aa  393  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3178  tryptophan halogenase  39.18 
 
 
543 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0464622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1212  tryptophan halogenase  38.99 
 
 
543 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.381407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3276  tryptophan halogenase  40.53 
 
 
520 aa  389  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.698237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1143  tryptophan halogenase  39.28 
 
 
528 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1105  ATPase  38.68 
 
 
517 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0939  tryptophan halogenase  39.68 
 
 
507 aa  371  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.220698  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1306  tryptophan halogenase  42.03 
 
 
507 aa  368  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.85539 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1964  tryptophan halogenase  38.76 
 
 
531 aa  362  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2941  tryptophan halogenase  39.92 
 
 
511 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.368226  normal  0.400178 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2293  tryptophan halogenase  38.98 
 
 
537 aa  356  5e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2707  tryptophan halogenase  39.31 
 
 
515 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1604  tryptophan halogenase  41.02 
 
 
513 aa  351  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3120  tryptophan halogenase  40.39 
 
 
510 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765985  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0915  tryptophan halogenase  41.36 
 
 
505 aa  348  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1398  hypothetical protein  35.47 
 
 
520 aa  326  6e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000535244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1139  tryptophan halogenase  35.08 
 
 
508 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.340428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1079  tryptophan halogenase  34.88 
 
 
508 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.488063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3216  tryptophan halogenase  34.82 
 
 
505 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.64533  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1395  tryptophan halogenase  34.36 
 
 
529 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1365  tryptophan halogenase  34.36 
 
 
529 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6983  tryptophan halogenase  33.97 
 
 
538 aa  286  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.448897  normal  0.89609 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5264  tryptophan halogenase  34.34 
 
 
538 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4726  tryptophan halogenase  34.15 
 
 
538 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2723  tryptophan halogenase  38.1 
 
 
509 aa  281  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189353  normal  0.019057 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6706  tryptophan halogenase  34.75 
 
 
537 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2733  tryptophan halogenase PrnA  33.96 
 
 
538 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2885  tryptophan halogenase PrnA  33.77 
 
 
538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1115  tryptophan halogenase  33.96 
 
 
538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1840  tryptophan halogenase  37.25 
 
 
506 aa  269  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.105646  hitchhiker  0.00205784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1866  tryptophan halogenase  36.61 
 
 
501 aa  266  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1853  tryptophan halogenase  34.38 
 
 
497 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.930503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01880  putative tryptophan halogenase  35.76 
 
 
506 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.198232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0992  putative tryptophan halogenase  35.92 
 
 
496 aa  263  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259329  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4005  formylmethionine deformylase  35.12 
 
 
498 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.182317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1839  tryptophan halogenase  36.29 
 
 
501 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.703806  hitchhiker  0.00201458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2138  tryptophan halogenase  36.35 
 
 
501 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903949  normal  0.0562186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3278  tryptophan halogenase  38.18 
 
 
518 aa  261  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3277  tryptophan halogenase  34.58 
 
 
510 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3936  tryptophan halogenase  32.83 
 
 
511 aa  258  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2037  tryptophan halogenase  36.99 
 
 
499 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.112783  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1094  allophanate hydrolase subunit 2  37.27 
 
 
515 aa  257  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.631655  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2301  tryptophan halogenase  36.53 
 
 
499 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.315145  normal  0.236324 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2084  tryptophan halogenase  36.76 
 
 
499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1114  tryptophan halogenase  35.21 
 
 
502 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.650107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2721  tryptophan halogenase  36.36 
 
 
507 aa  253  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000284489  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1786  tryptophan halogenase  37.64 
 
 
507 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2734  tryptophan halogenase  37.67 
 
 
504 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.816599 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3734  putative tryptophan halogenase  32.75 
 
 
496 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4289  tryptophan halogenase  36.93 
 
 
492 aa  251  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2064  tryptophan halogenase  34.11 
 
 
500 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0180513  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1607  tryptophan halogenase  35.21 
 
 
505 aa  249  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3700  putative tryptophan halogenase  32.44 
 
 
494 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2143  tryptophan halogenase  39.09 
 
 
512 aa  249  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0261967  normal  0.0242357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1882  tryptophan halogenase  35.16 
 
 
501 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0761286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0588  response regulator receiver domain-containing protein  33.1 
 
 
502 aa  248  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.917971  decreased coverage  0.00918466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3817  tryptophan halogenase  34.55 
 
 
497 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.270075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2724  tryptophan halogenase  38.81 
 
 
510 aa  247  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.262395  normal  0.0424923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1842  tryptophan halogenase  39.82 
 
 
505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00202997  hitchhiker  0.000756616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3937  tryptophan halogenase  33.53 
 
 
502 aa  242  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.792717  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2144  tryptophan halogenase  34.12 
 
 
504 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0060883  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0918  tryptophan halogenase  34.27 
 
 
503 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1889  tryptophan halogenase  35.53 
 
 
504 aa  240  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03613  tryptophan halogenase  37.36 
 
 
509 aa  240  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1140  tryptophan halogenase  33.27 
 
 
500 aa  240  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1209  tryptophan halogenase  34.25 
 
 
503 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.312484  normal  0.925152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1096  tryptophan halogenase, putative  34.05 
 
 
498 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000328239  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1401  IspG protein  37.99 
 
 
496 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3181  tryptophan halogenase  34.05 
 
 
503 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.025127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1121  tryptophan halogenase  34.05 
 
 
503 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1176  tryptophan halogenase  34.05 
 
 
503 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3938  tryptophan halogenase  33.59 
 
 
505 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2733  tryptophan halogenase  32.82 
 
 
505 aa  237  4e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2498  tryptophan halogenase, putative  32.88 
 
 
501 aa  236  7e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>