More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2769 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  100 
 
 
565 aa  1117    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  41.43 
 
 
605 aa  345  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  40.24 
 
 
606 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  35.43 
 
 
359 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  37.57 
 
 
568 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  37.04 
 
 
568 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  35.71 
 
 
639 aa  99  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  27.25 
 
 
542 aa  92  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  38.64 
 
 
553 aa  92  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  35.39 
 
 
668 aa  87  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  35.29 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  33.16 
 
 
749 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  28.63 
 
 
325 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  25.67 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.84 
 
 
346 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.79 
 
 
346 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  35.76 
 
 
569 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  31.29 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  31.29 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  35.71 
 
 
561 aa  74.3  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  25.83 
 
 
546 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  28.9 
 
 
337 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  30.81 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0968  TrkA-N domain protein  26.06 
 
 
544 aa  70.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.153037 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  29.02 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  29.45 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  29.45 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  29.45 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  29.45 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.7 
 
 
332 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  25.93 
 
 
544 aa  69.7  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  28.32 
 
 
330 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  29.45 
 
 
330 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  27.12 
 
 
548 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
355 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.19 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.01 
 
 
330 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  30.2 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 
350 aa  66.6  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  24.64 
 
 
351 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  31.79 
 
 
346 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  25.33 
 
 
564 aa  65.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  31.79 
 
 
324 aa  65.5  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  34.27 
 
 
575 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
252 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  26.27 
 
 
683 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  27.34 
 
 
337 aa  64.7  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.93 
 
 
371 aa  64.3  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  24.61 
 
 
564 aa  64.7  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  27.5 
 
 
676 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  24.92 
 
 
564 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  28.89 
 
 
352 aa  63.9  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.67 
 
 
350 aa  64.3  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  34.23 
 
 
345 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  31.43 
 
 
682 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  26.76 
 
 
569 aa  63.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  32.18 
 
 
350 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  26.5 
 
 
676 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  24.62 
 
 
454 aa  61.6  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  38.38 
 
 
658 aa  61.6  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  27.98 
 
 
351 aa  61.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  29.58 
 
 
251 aa  61.6  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  26.96 
 
 
445 aa  61.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0527  TrkA domain-containing protein  23.93 
 
 
564 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.630061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0161  TrkA domain-containing protein  25.49 
 
 
568 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000200021  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  26.7 
 
 
352 aa  59.7  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  24.86 
 
 
583 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  28.31 
 
 
458 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  28.5 
 
 
359 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1453  potassium transporter peripheral membrane component  28.31 
 
 
458 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.687964  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  28.16 
 
 
346 aa  58.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  35 
 
 
335 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1569  potassium transporter peripheral membrane component  27.49 
 
 
458 aa  57.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0202479  normal  0.0449671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 
666 aa  57.8  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
336 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  24.84 
 
 
339 aa  57.4  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  34.29 
 
 
341 aa  57  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  34.31 
 
 
335 aa  57  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2691  TrkA-N domain protein  24.77 
 
 
562 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.557317  normal  0.0657771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  23.69 
 
 
450 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  25.76 
 
 
458 aa  56.6  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  35.24 
 
 
335 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.53 
 
 
335 aa  55.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  28.14 
 
 
221 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  38.1 
 
 
674 aa  55.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  32.17 
 
 
331 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  34.31 
 
 
565 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  32.73 
 
 
364 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  30.91 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.13 
 
 
384 aa  56.2  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05273  hypothetical protein  30.89 
 
 
652 aa  55.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1491  potassium transporter peripheral membrane component  28.01 
 
 
458 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  30.46 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  27.7 
 
 
351 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  28.72 
 
 
364 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  25.23 
 
 
366 aa  55.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  33 
 
 
417 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>