110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_4414 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  48.03 
 
 
683 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  100 
 
 
676 aa  1372    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  63.61 
 
 
682 aa  823    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  99.41 
 
 
676 aa  1367    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  22.66 
 
 
568 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  22.66 
 
 
568 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  25.05 
 
 
565 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  25.49 
 
 
561 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  21.66 
 
 
749 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  23.39 
 
 
569 aa  94  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  25.88 
 
 
639 aa  88.2  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  25.1 
 
 
668 aa  83.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  22.59 
 
 
553 aa  80.9  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 
325 aa  65.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  26.2 
 
 
606 aa  64.3  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  30.51 
 
 
605 aa  64.3  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  30.83 
 
 
563 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  25.57 
 
 
364 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 
350 aa  59.3  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  25.57 
 
 
364 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
252 aa  58.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  23.96 
 
 
364 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  25.23 
 
 
386 aa  57.4  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  25.45 
 
 
324 aa  56.6  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  23.5 
 
 
364 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  23.79 
 
 
332 aa  56.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  26.79 
 
 
565 aa  54.7  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  23.63 
 
 
362 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  23.32 
 
 
341 aa  53.9  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  27.78 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  27.78 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2139  potassium efflux system protein  29.27 
 
 
602 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.199243 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  24.24 
 
 
564 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  29.1 
 
 
364 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  29.1 
 
 
364 aa  53.9  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  26.7 
 
 
339 aa  53.9  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  27.78 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  27.78 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  27.78 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  27.78 
 
 
402 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  27.78 
 
 
402 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  27.78 
 
 
417 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2355  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.91 
 
 
602 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  30.1 
 
 
347 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  22.47 
 
 
332 aa  52.8  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  21.72 
 
 
368 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  29.69 
 
 
350 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  28.12 
 
 
575 aa  52  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48700  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.11 
 
 
613 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00097615 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  25.69 
 
 
335 aa  52.4  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4171  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB  24.2 
 
 
613 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 
335 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  26.98 
 
 
417 aa  52  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  23.5 
 
 
326 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  23.5 
 
 
326 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  23.5 
 
 
326 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  23.5 
 
 
326 aa  51.6  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  29.25 
 
 
352 aa  51.2  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  25.45 
 
 
352 aa  50.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  23.18 
 
 
413 aa  50.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  21.99 
 
 
357 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  30.17 
 
 
564 aa  50.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  23.18 
 
 
369 aa  50.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  22.86 
 
 
341 aa  50.4  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  19.22 
 
 
350 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  23.18 
 
 
369 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  23.18 
 
 
369 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  21.72 
 
 
351 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  24.76 
 
 
335 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  29.91 
 
 
331 aa  49.3  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  28.57 
 
 
359 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6351  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 
266 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.514037  normal  0.641352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  25.78 
 
 
355 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  28.71 
 
 
251 aa  48.9  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.28 
 
 
346 aa  48.5  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  33.62 
 
 
649 aa  47.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  31.73 
 
 
346 aa  47.4  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  29.91 
 
 
351 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  24.04 
 
 
332 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  35.65 
 
 
648 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  35.65 
 
 
648 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  20.9 
 
 
333 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  27.1 
 
 
562 aa  46.6  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0087  potassium transporter peripheral membrane component  23.85 
 
 
466 aa  46.2  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  23.18 
 
 
217 aa  46.6  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  23.64 
 
 
347 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  28.93 
 
 
539 aa  46.2  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.76 
 
 
648 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 
330 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  32.69 
 
 
653 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0711  sodium/hydrogen exchanger  27.13 
 
 
581 aa  45.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  21.09 
 
 
569 aa  46.6  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.9 
 
 
368 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  26.55 
 
 
350 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  34.78 
 
 
648 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  27.48 
 
 
337 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.7 
 
 
334 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  25.23 
 
 
366 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.13 
 
 
330 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>