More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3336 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
359 aa  725    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  37.83 
 
 
606 aa  206  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  37.5 
 
 
605 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  35.43 
 
 
565 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  33.58 
 
 
668 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  35.19 
 
 
639 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  26.51 
 
 
749 aa  103  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  39.19 
 
 
568 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  38.51 
 
 
568 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.36 
 
 
330 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  29.82 
 
 
553 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.43 
 
 
330 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.13 
 
 
330 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  30.77 
 
 
569 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  26.73 
 
 
676 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.83 
 
 
330 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 
676 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  32.75 
 
 
565 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.13 
 
 
334 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.83 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.83 
 
 
334 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.59 
 
 
337 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  24.22 
 
 
683 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  34.04 
 
 
561 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  24.84 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.34 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  28.51 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  28.67 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  30.97 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  26.56 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  28.7 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  26.61 
 
 
682 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  27.56 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  34.95 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  35.4 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  35.14 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  36.36 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  26.67 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.99 
 
 
347 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  34.21 
 
 
563 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  25.22 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.76 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  28.38 
 
 
359 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  26.99 
 
 
351 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  26.41 
 
 
346 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.55 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  30.67 
 
 
220 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.09 
 
 
335 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  29.93 
 
 
352 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  33.63 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  34.56 
 
 
546 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  24.64 
 
 
569 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28 
 
 
335 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  28.63 
 
 
350 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 
350 aa  63.5  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  25.91 
 
 
350 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  28.09 
 
 
182 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  25.97 
 
 
346 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  30.47 
 
 
339 aa  63.2  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  24.9 
 
 
351 aa  63.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  32.35 
 
 
575 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  37.25 
 
 
531 aa  62.8  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  28.29 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  24.17 
 
 
656 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  31.58 
 
 
252 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 
364 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 
413 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  30.52 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  25.55 
 
 
454 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  31.17 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
223 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  27.07 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  31.17 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  27.07 
 
 
351 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  27.07 
 
 
351 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  27.07 
 
 
351 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  30.52 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  25.93 
 
 
346 aa  60.1  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  30.52 
 
 
326 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 
364 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  30.48 
 
 
642 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1092  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 
642 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163516  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  30.47 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  30.89 
 
 
564 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  26.57 
 
 
583 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  34.13 
 
 
564 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  29.41 
 
 
335 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  28.22 
 
 
222 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03220  K+ transport system, NAD-binding component  33.86 
 
 
650 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.18 
 
 
354 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>