More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1590 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  100 
 
 
252 aa  488  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  46.86 
 
 
251 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  30.04 
 
 
351 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  28.81 
 
 
351 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  31.08 
 
 
350 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  28.45 
 
 
332 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.73 
 
 
335 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  29.28 
 
 
325 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 
355 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  28.37 
 
 
350 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  30.04 
 
 
330 aa  95.5  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  29.73 
 
 
347 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 
384 aa  94.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  32.76 
 
 
356 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  32.76 
 
 
356 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 
350 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27.56 
 
 
350 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 
333 aa  93.2  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  26.36 
 
 
345 aa  93.2  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  28.28 
 
 
346 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  37.59 
 
 
351 aa  89.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  33.57 
 
 
366 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.79 
 
 
351 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.79 
 
 
351 aa  89.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  34.27 
 
 
346 aa  89  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.79 
 
 
351 aa  89  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  28.57 
 
 
337 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.46 
 
 
371 aa  89.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  30.64 
 
 
354 aa  89  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  30.06 
 
 
338 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  31.47 
 
 
346 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.83 
 
 
359 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  27.78 
 
 
330 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  33.33 
 
 
352 aa  86.3  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  27.06 
 
 
330 aa  85.5  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  22.88 
 
 
351 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  30.56 
 
 
352 aa  85.5  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.56 
 
 
350 aa  85.1  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  30.06 
 
 
362 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  27.31 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  29.59 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  26.85 
 
 
337 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  27.31 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  27.31 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  27.31 
 
 
330 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  25.2 
 
 
357 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  28.99 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  25.21 
 
 
346 aa  82  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  29.59 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 
341 aa  79.7  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  28.16 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  26.29 
 
 
509 aa  78.6  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  27.31 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  26.59 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.2 
 
 
355 aa  77  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  26.83 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  28.65 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  21.7 
 
 
339 aa  75.1  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  33.33 
 
 
575 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  29.23 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.39 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  29.23 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  34.43 
 
 
771 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.94 
 
 
350 aa  72  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  31.69 
 
 
388 aa  72  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  31.51 
 
 
659 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  28.51 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.3 
 
 
697 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  29.77 
 
 
672 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  38.05 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  33.82 
 
 
655 aa  69.7  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  29.48 
 
 
654 aa  70.1  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  31.72 
 
 
652 aa  69.7  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 
665 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  31.78 
 
 
546 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  28.79 
 
 
665 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  31.01 
 
 
660 aa  68.6  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3503  TrkA domain-containing protein  29.61 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  31.78 
 
 
660 aa  68.6  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 
666 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  33.33 
 
 
569 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  34.71 
 
 
668 aa  68.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  28.24 
 
 
666 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
773 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  30.19 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  35.37 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  28.3 
 
 
583 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  23.18 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  28.23 
 
 
256 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 
339 aa  67  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  29.55 
 
 
762 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 
345 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  26.78 
 
 
656 aa  65.9  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  29.71 
 
 
542 aa  66.2  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  27.27 
 
 
775 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  28.08 
 
 
659 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>