More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2853 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  59.75 
 
 		 568 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  100 
 
 		 561 aa  1150    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  60.18 
 
 		 565 aa  701    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  59.57 
 
 		 568 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  25.17 
 
 		 683 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  26.02 
 
 		 749 aa  137  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  27.82 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  28.43 
 
 		 569 aa  123  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  27.71 
 
 		 639 aa  115  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  25.49 
 
 		 676 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  25.49 
 
 		 676 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  22.96 
 
 		 682 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  42.98 
 
 		 606 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  30.23 
 
 		 668 aa  96.3  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  47 
 
 		 605 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  28.79 
 
 		 338 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  28.53 
 
 		 354 aa  88.6  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 		 362 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  27.35 
 
 		 355 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  34.04 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  28.06 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  26.97 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  27 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  27 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  28.08 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  26.64 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.13 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  41.05 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 		 347 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.8 
 
 		 335 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  26.5 
 
 		 351 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  28.95 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  25.99 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  26.89 
 
 		 384 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.83 
 
 		 335 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  26.44 
 
 		 350 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.26 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  26.77 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  26.07 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  27.88 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  27.93 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  30.54 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  26.32 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  26.32 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  26.09 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  26.32 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  25.32 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  25.32 
 
 		 417 aa  67  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  25.32 
 
 		 417 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  29.94 
 
 		 335 aa  66.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.69 
 
 		 324 aa  66.6  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  22.94 
 
 		 357 aa  67  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  30.83 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.79 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.6 
 
 		 330 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  25.74 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  30.83 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.23 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  27.54 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.03 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  30.83 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  32.43 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  25.84 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  23.53 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  33.64 
 
 		 564 aa  63.9  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  32.21 
 
 		 352 aa  63.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  31.89 
 
 		 564 aa  63.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  32.35 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  24.04 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  28.28 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0848  TrkA-N  29.23 
 
 		 347 aa  62  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0423628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  25.98 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  21.13 
 
 		 355 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.3 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  41.18 
 
 		 583 aa  61.6  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0210  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  28.42 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  24.19 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.13 
 
 		 655 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3503  TrkA domain-containing protein  27.37 
 
 		 261 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  31.19 
 
 		 346 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  30.99 
 
 		 762 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  28.04 
 
 		 256 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 		 668 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  21.84 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  25.23 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  25.63 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  21.84 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  21.84 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  29.25 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  31.19 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>