81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0210 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0210  TrkA-N domain protein  100 
 
 
460 aa  900    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196542  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  27.61 
 
 
569 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  29.83 
 
 
553 aa  97.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  25.37 
 
 
639 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  31.1 
 
 
668 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  28.8 
 
 
561 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  32.23 
 
 
606 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  32.37 
 
 
749 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  24.14 
 
 
568 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  23.75 
 
 
568 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  28.12 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  27.27 
 
 
565 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  27.46 
 
 
683 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  35.19 
 
 
605 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  32 
 
 
347 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  23.32 
 
 
682 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  23.31 
 
 
676 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  23.6 
 
 
676 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  25.12 
 
 
325 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  33.65 
 
 
565 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  21.54 
 
 
335 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  21.03 
 
 
335 aa  53.5  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  27.62 
 
 
345 aa  53.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  35.35 
 
 
668 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  24.83 
 
 
546 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  25.12 
 
 
563 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
665 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 
665 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  25.84 
 
 
337 aa  51.6  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  24.81 
 
 
575 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  20 
 
 
335 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  36.46 
 
 
248 aa  50.1  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  26.92 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  42.5 
 
 
233 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  24.46 
 
 
357 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  25.99 
 
 
366 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  34.65 
 
 
693 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  32.41 
 
 
341 aa  48.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  28.7 
 
 
762 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  24.15 
 
 
351 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03220  K+ transport system, NAD-binding component  24.79 
 
 
650 aa  47.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  24.11 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  30.82 
 
 
346 aa  47.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  24.11 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  30.56 
 
 
670 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.11 
 
 
330 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  27.5 
 
 
352 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  25.96 
 
 
351 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  25.96 
 
 
351 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  24.11 
 
 
330 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  23.92 
 
 
351 aa  47  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1539  TrkA-N domain protein  33.06 
 
 
222 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  24.11 
 
 
330 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  23.49 
 
 
337 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  29.51 
 
 
352 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
218 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  25.96 
 
 
351 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  20.86 
 
 
355 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
236 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  24.29 
 
 
352 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  26.49 
 
 
371 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  27.97 
 
 
251 aa  44.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  22.01 
 
 
350 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  27.48 
 
 
658 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  30 
 
 
222 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.95 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  21.76 
 
 
350 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  27.41 
 
 
350 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  34.12 
 
 
214 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26 
 
 
347 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  31.13 
 
 
562 aa  43.5  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  24.64 
 
 
350 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  25.11 
 
 
542 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  19.4 
 
 
341 aa  43.9  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  37.21 
 
 
214 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  20.78 
 
 
350 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  33.98 
 
 
666 aa  43.5  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  31.93 
 
 
666 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  22.7 
 
 
330 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  21.9 
 
 
324 aa  43.1  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.47 
 
 
346 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>