145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3105 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3105  TrkA-N  100 
 
 		 683 aa  1406    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.716552 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4414  TrkA-N domain protein  48.03 
 
 		 676 aa  636    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4477  TrkA-N domain protein  48.61 
 
 		 676 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4226  TrkA-N domain protein  48.51 
 
 		 682 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3306  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 		 568 aa  194  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.484589 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2794  TrkA-N domain protein  27.4 
 
 		 568 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  26.05 
 
 		 565 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2853  TrkA-N  25.34 
 
 		 561 aa  143  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2117  TrkA-N domain protein  24.5 
 
 		 569 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0022  TrkA-N domain-containing protein  21.79 
 
 		 553 aa  91.3  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.377987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0283  TrkA domain-containing protein  20.92 
 
 		 639 aa  90.5  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244298  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0242  TrkA domain-containing protein  23.34 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  24.22 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  22.91 
 
 		 749 aa  68.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  35 
 
 		 606 aa  68.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  33.87 
 
 		 575 aa  67.4  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  26.27 
 
 		 565 aa  64.7  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  31.36 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  23.77 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  24.46 
 
 		 350 aa  63.9  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  32.17 
 
 		 252 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  29.61 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  25.57 
 
 		 359 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  33.85 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  30.09 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  30.09 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  30.09 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000079785  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  27.64 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  30.09 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  30.09 
 
 		 417 aa  57  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  27.64 
 
 		 402 aa  57  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  33.61 
 
 		 388 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  32.43 
 
 		 345 aa  57  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  30.09 
 
 		 402 aa  57  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  23.33 
 
 		 357 aa  56.6  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  22.29 
 
 		 324 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  24.82 
 
 		 668 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 		 335 aa  55.1  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  29.2 
 
 		 417 aa  55.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  31.09 
 
 		 564 aa  54.7  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  28.04 
 
 		 325 aa  53.9  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  22.22 
 
 		 341 aa  53.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  25.5 
 
 		 332 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0210  TrkA-N domain protein  24.88 
 
 		 460 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.196542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  25.47 
 
 		 330 aa  52.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  26.27 
 
 		 368 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  28.75 
 
 		 762 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 		 562 aa  52  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  28.23 
 
 		 542 aa  51.6  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.41 
 
 		 655 aa  51.2  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  26.32 
 
 		 335 aa  51.2  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.99 
 
 		 330 aa  51.2  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  24.83 
 
 		 332 aa  51.2  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3503  TrkA domain-containing protein  25.98 
 
 		 261 aa  51.2  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  21.76 
 
 		 569 aa  50.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2469  putative efflux pump/antiporter  28.47 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0878577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  24.26 
 
 		 564 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  25.21 
 
 		 334 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  25.21 
 
 		 334 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  24.22 
 
 		 564 aa  49.7  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  26.67 
 
 		 583 aa  49.7  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1388  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 486 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  26.32 
 
 		 335 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  21.02 
 
 		 336 aa  49.7  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1288  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 486 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.444539 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  30 
 
 		 251 aa  50.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0668  TrkA domain-containing protein  36.36 
 
 		 486 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.478375  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  30.17 
 
 		 352 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  25.21 
 
 		 330 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4312  TrkA-N domain protein  25.58 
 
 		 548 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25 
 
 		 332 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  25.21 
 
 		 330 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.29 
 
 		 395 aa  49.3  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.55 
 
 		 337 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  26.4 
 
 		 773 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 347 aa  48.5  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  27.15 
 
 		 595 aa  48.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  25 
 
 		 218 aa  48.1  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  28.68 
 
 		 531 aa  48.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  24.17 
 
 		 341 aa  48.1  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  23.32 
 
 		 450 aa  48.1  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0900  TrkA domain-containing protein  28.43 
 
 		 511 aa  47.8  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  27.78 
 
 		 346 aa  47.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.44 
 
 		 330 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  25.22 
 
 		 347 aa  47.8  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  24.79 
 
 		 457 aa  47.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  23.61 
 
 		 663 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  24.63 
 
 		 384 aa  47  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  24.32 
 
 		 339 aa  47.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 		 549 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.551813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  26.27 
 
 		 364 aa  47  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  25.42 
 
 		 364 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  26.73 
 
 		 666 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  30.23 
 
 		 567 aa  46.6  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0899  TrkA domain-containing protein  24.82 
 
 		 567 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0353  potassium transporter peripheral membrane component  26.52 
 
 		 458 aa  46.2  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  29.36 
 
 		 648 aa  45.8  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  26.52 
 
 		 217 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  25.21 
 
 		 339 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0035  potassium transporter peripheral membrane component  26.71 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.154438 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>