139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03220 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03220  K+ transport system, NAD-binding component  100 
 
 		 650 aa  1309    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1436  TrkA-N domain protein  39.65 
 
 		 614 aa  389  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2252  TrkA-N domain protein  37.04 
 
 		 607 aa  342  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000542956  normal  0.119281 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2378  TrkA-N  34.38 
 
 		 575 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2004  TrkA-N domain protein  35.28 
 
 		 579 aa  323  7e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.88767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0126  TrkA-N domain protein  33.71 
 
 		 546 aa  313  9e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379824  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2071  TrkA-N  31.78 
 
 		 564 aa  302  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0370371  normal  0.79514 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0498  TrkA-N  31.23 
 
 		 563 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2358  TrkA domain-containing protein  31.53 
 
 		 564 aa  293  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2528  TrkA domain-containing protein  32.5 
 
 		 583 aa  292  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2287  TrkA domain-containing protein  31.84 
 
 		 564 aa  272  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0076  TrkA-N domain protein  26 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  23.37 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  27.11 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  27.59 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  25.41 
 
 		 351 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  25.67 
 
 		 332 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  20.39 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  23.14 
 
 		 350 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  24.09 
 
 		 333 aa  69.7  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  25.29 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  21.48 
 
 		 351 aa  67  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  25.37 
 
 		 346 aa  67  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  28.04 
 
 		 352 aa  66.6  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  29.36 
 
 		 351 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  25.83 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  22.05 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  22.05 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  27.19 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  27.15 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  24.38 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  27.32 
 
 		 531 aa  65.1  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  26.51 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  28.44 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  28.44 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  25.1 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  26.61 
 
 		 509 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  28.44 
 
 		 351 aa  63.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  24.32 
 
 		 337 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  23.16 
 
 		 325 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 		 330 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 		 332 aa  63.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  23.97 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  20.7 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  24.71 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  26.24 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  26.25 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  29.49 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.52 
 
 		 350 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  26.24 
 
 		 356 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  23.75 
 
 		 355 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  23.42 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  23.42 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  23.42 
 
 		 330 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4290  TrkA domain-containing protein  36.07 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.286091  decreased coverage  0.00534263 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.12 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  23.87 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  23.32 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  24.81 
 
 		 341 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0931  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.18233  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  20.92 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  27.27 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  43.53 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3336  TrkA domain-containing protein  33.86 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819763  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  24.91 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  23.27 
 
 		 366 aa  57  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  22.22 
 
 		 339 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  22.75 
 
 		 335 aa  56.6  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  24.75 
 
 		 384 aa  56.6  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  22.5 
 
 		 336 aa  55.5  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 		 454 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  26.56 
 
 		 341 aa  55.1  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  22.17 
 
 		 330 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  26.69 
 
 		 346 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1881  TrkA-N  23.53 
 
 		 498 aa  54.7  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  21.4 
 
 		 335 aa  54.3  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  23.67 
 
 		 341 aa  54.3  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4032  TrkA-N  24.9 
 
 		 565 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.341469 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  29.09 
 
 		 252 aa  53.5  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  26.69 
 
 		 346 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  24.68 
 
 		 438 aa  53.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  24.68 
 
 		 408 aa  52.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  37.93 
 
 		 444 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25.81 
 
 		 352 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  25 
 
 		 359 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0055  TrkA-N domain protein  23.86 
 
 		 336 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  23.11 
 
 		 359 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  24.63 
 
 		 388 aa  51.2  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2769  TrkA-N domain protein  32.46 
 
 		 565 aa  50.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  24.07 
 
 		 417 aa  51.2  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  24.07 
 
 		 402 aa  50.8  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0720  TrkA-N  24.56 
 
 		 355 aa  50.4  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  24.07 
 
 		 402 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0139159 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  24.07 
 
 		 417 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  24.07 
 
 		 417 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2939  TrkA-N  27.18 
 
 		 749 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  23.29 
 
 		 397 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  23.98 
 
 		 345 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.793307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0644  TrkA domain-containing protein  23.98 
 
 		 339 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247838  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>