81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1026 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1026  putative RNA methylase  100 
 
 
379 aa  758    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3569  putative RNA methylase  44.41 
 
 
430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2582  putative RNA methylase  39.5 
 
 
362 aa  203  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2801  putative RNA methylase  39.46 
 
 
368 aa  194  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0020  putative RNA methylase  33.7 
 
 
359 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2993  putative RNA methylase  34.57 
 
 
350 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2276  putative RNA methylase  34.57 
 
 
349 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0253  putative RNA methylase  24.78 
 
 
360 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  27.79 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  28.12 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  37.4 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6055  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  31.95 
 
 
322 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  30.95 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  31.85 
 
 
344 aa  64.7  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  27.33 
 
 
355 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  33.82 
 
 
318 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  30.41 
 
 
317 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  27.81 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  24.61 
 
 
334 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  29.93 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2035  putative RNA methylase  24.47 
 
 
395 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000306959  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  29.55 
 
 
346 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  24.61 
 
 
333 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  30.18 
 
 
374 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15560  predicted N6-adenine-specific DNA methylase  28.37 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0477  putative RNA methylase  28.64 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0293  putative RNA methylase  23.27 
 
 
377 aa  53.1  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.107871  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  28.08 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  30 
 
 
254 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0494  putative RNA methylase  28.18 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00380676 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  26.92 
 
 
314 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
254 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
225 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1236  putative RNA methylase  27.1 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1302  putative RNA methylase  27.85 
 
 
510 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  25.41 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  26.45 
 
 
336 aa  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0218  putative RNA methylase  30.89 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547055 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  26.69 
 
 
330 aa  47  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1453  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.73 
 
 
246 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00782533  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02010  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  26.05 
 
 
699 aa  46.2  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.347097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3242  putative RNA methylase  25.23 
 
 
382 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000019855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  32.08 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2381  putative RNA methylase  27.37 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3086  hypothetical protein  29.55 
 
 
391 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  27.7 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  26.53 
 
 
351 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2470  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  21.11 
 
 
711 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000238626  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0074  putative RNA methylase  22.88 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1420  putative RNA methylase  29.24 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00712049  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1600  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  22.96 
 
 
708 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1032  putative RNA methylase  28.93 
 
 
399 aa  44.7  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1020  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  36.08 
 
 
718 aa  44.7  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164858  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0429  putative RNA methylase  24.72 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.000469504  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.73 
 
 
260 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  30.77 
 
 
304 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2376  Methyltransferase type 11  32 
 
 
210 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578401  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1812  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.66 
 
 
711 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0884579  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.73 
 
 
234 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  26.53 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5876  putative RNA methylase  41.03 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0137254  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0392  N-6 DNA methylase  24.5 
 
 
967 aa  43.9  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  29.1 
 
 
365 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1851  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.01 
 
 
711 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1533  hypothetical protein  21.52 
 
 
381 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1504  hypothetical protein  21.52 
 
 
381 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2359  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.82 
 
 
237 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2355  putative RNA methylase  23.26 
 
 
393 aa  43.1  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00636349  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1607  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.46 
 
 
713 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710463  normal  0.246745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1904  putative RNA methylase  28.21 
 
 
384 aa  43.1  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 
234 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.9 
 
 
245 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1601  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.46 
 
 
713 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.867514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1540  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.46 
 
 
713 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10175  predicted protein  28.8 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.101651  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1632  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  29.01 
 
 
709 aa  43.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0586736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.14 
 
 
256 aa  43.1  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1946  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  28.24 
 
 
711 aa  42.7  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.478167  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  29.25 
 
 
1425 aa  42.7  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0366  putative RNA methylase  22.11 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>