63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6531 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6531  putative ABC transporter transmembrane protein  100 
 
 		 271 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.250504  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5721  putative ABC transporter transmembrane protein  43.66 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3715  hypothetical protein  39.92 
 
 		 271 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00760825  normal  0.204934 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3766  hypothetical protein  39.13 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  34.92 
 
 		 379 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3183  putative ABC transporter transmembrane protein  37.07 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2965  hypothetical protein  37.96 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00474996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08100  hypothetical protein  33.46 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00355717  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1993  hypothetical protein  45.93 
 
 		 301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3385  hypothetical protein  36.9 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010622  hitchhiker  0.000616715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  35.02 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1051  putative integral membrane transport protein  34.2 
 
 		 294 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4136  ABC transporter, integral membrane subunit  31.82 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2017  integral membrane protein  38.89 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257608  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2674  hypothetical protein  34.78 
 
 		 292 aa  119  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  35.69 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0580  putative ABC transporter transmembrane protein  31.35 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105564  normal  0.124496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2174  hypothetical protein  38.28 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.347579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4036  putative ABC transporter transmembrane protein  30.56 
 
 		 297 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0183808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  32.54 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0118  putative ABC transporter transmembrane protein  34.87 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.445398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  34.1 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0250  putative ABC transporter transmembrane protein  32.13 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0920  putative ABC transporter transmembrane protein  33.58 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.19506  normal  0.672531 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3914  ABC transporter, integral membrane subunit  30.95 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7102  hypothetical protein  25.86 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1430  putative ABC transporter transmembrane protein  33.95 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  32.86 
 
 		 750 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6408  hypothetical protein  34.82 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0022  putative integral membrane transport protein  30.86 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4554  hypothetical protein  34.5 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4129  hypothetical protein  28.72 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1979  integral membrane protein  32.23 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5616  hypothetical protein  32.42 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284807  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1899  hypothetical protein  31.43 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0443788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1737  hypothetical protein  29.39 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2000  putative ABC transporter transmembrane protein  38.39 
 
 		 279 aa  67.4  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4580  hypothetical protein  39.22 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189459 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2131  ABC transporter integral membrane protein  34.36 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2645  hypothetical protein  32.28 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00521204  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6354  putative ABC transporter integral membrane subunit  29.34 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  29.21 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5647  hypothetical protein  31.77 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2845  integral membrane protein  33.5 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4340  putative ABC transporter membrane protein  29.12 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4256  ABC transporter integral membrane protein  28.34 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  28.9 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.405828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  31.29 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0101  hypothetical protein  23.95 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.250348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2235  hypothetical protein  29.57 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0562  putative ABC transporter membrane protein  29.58 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0540  putative ABC transporter membrane protein  29.58 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0550  putative ABC transporter membrane protein  29.58 
 
 		 246 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0312  hypothetical protein  29.18 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.228119 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5465  hypothetical protein  30.65 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal  0.155763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5648  hypothetical protein  32.05 
 
 		 518 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1978  integral membrane protein  38.26 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0713  putative ABC transporter membrane protein  30.73 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00955733  normal  0.0414517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  30.04 
 
 		 246 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03510  hypothetical protein  34.58 
 
 		 302 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5874  hypothetical protein  38.71 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.138956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3689  hypothetical protein  25.61 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1435  putative integral membrane protein  28.52 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.973684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>