44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4682 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 565 aa  1140    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  45.52 
 
 		 558 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  37.54 
 
 		 561 aa  343  7e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.75 
 
 		 544 aa  334  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  34.64 
 
 		 557 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  35 
 
 		 552 aa  317  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  36.98 
 
 		 548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  32.9 
 
 		 537 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  34.11 
 
 		 532 aa  288  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.75 
 
 		 564 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  31.03 
 
 		 552 aa  256  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  30.32 
 
 		 560 aa  242  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 		 563 aa  236  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 547 aa  183  7e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.24 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 		 544 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  26.49 
 
 		 552 aa  160  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  29.87 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  27.52 
 
 		 567 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 561 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26 
 
 		 544 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 509 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 510 aa  54.3  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 		 443 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  29.44 
 
 		 424 aa  50.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  31.65 
 
 		 455 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  30.88 
 
 		 442 aa  48.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 		 434 aa  47.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 525 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000666  phosphoserine phosphatase  26.96 
 
 		 219 aa  46.6  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  30.95 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 445 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  35 
 
 		 399 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  46.03 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.42 
 
 		 544 aa  45.1  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  35.09 
 
 		 442 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>