More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4023 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0248885  hitchhiker  0.0015787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5661  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.34 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  39.87 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  39.56 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  39.75 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  38.73 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  40.25 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  38.75 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  36.91 
 
 		 328 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0156  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  39.75 
 
 		 320 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  37.66 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  40.06 
 
 		 321 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  40.25 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  37.04 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  37.74 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  34.58 
 
 		 328 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  34.17 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  36.84 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23780  UDP-glucose 4-epimerase  38.31 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00097023  normal  0.178512 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  36.22 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  35.51 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  35.78 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  35.74 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  34.07 
 
 		 354 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  36.76 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  37.34 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  36.45 
 
 		 321 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  35.96 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 		 330 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  35.08 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  32.93 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  32.93 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  36.42 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  36.5 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  35.94 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  34.05 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  34.37 
 
 		 329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  37.11 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  36.65 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  35.78 
 
 		 327 aa  154  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 		 329 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  31.1 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  36.02 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  35.4 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  36.02 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  29.39 
 
 		 328 aa  153  5e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  31.82 
 
 		 328 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  34.98 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  31.52 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  32.31 
 
 		 326 aa  152  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  28.4 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  34.26 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  32.19 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  32.61 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  31.61 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  33.54 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  34.57 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  31.21 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  34.77 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  33.02 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  31.35 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  35.28 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  34.91 
 
 		 332 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  34.46 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 		 350 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  34.85 
 
 		 330 aa  149  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  34.98 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  34.7 
 
 		 325 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  34.16 
 
 		 329 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  32.71 
 
 		 330 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  34.25 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  34.76 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  29.94 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  31.87 
 
 		 332 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  33.75 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  35.94 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  33.64 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  35.94 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5373  UDP-glucose 4-epimerase  31.53 
 
 		 338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  hitchhiker  0.00471599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  36.22 
 
 		 335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  31.23 
 
 		 336 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  33.23 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  30.96 
 
 		 321 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 		 329 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  31.48 
 
 		 332 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  31.27 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  30.4 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  33.86 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  33.74 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5381  UDP-glucose 4-epimerase  30.33 
 
 		 338 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  34.67 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 		 342 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  31.45 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  32.23 
 
 		 334 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>