More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2756 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 133 aa  262  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  63.93 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  57.26 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  53.33 
 
 		 127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  51.69 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  50.86 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  51.72 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  52.14 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  51.3 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  51.3 
 
 		 124 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  51.3 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  51.3 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  51.3 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  51.72 
 
 		 124 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  52.14 
 
 		 124 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  51.35 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  44.44 
 
 		 228 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  51.72 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  44.07 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  49.57 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  45.13 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  47.83 
 
 		 122 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 122 aa  86.3  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  42.48 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  40.68 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  38.66 
 
 		 126 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  45.45 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  44.83 
 
 		 117 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.93 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  39.66 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  39.66 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  41.32 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  39.53 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  45.83 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  39.67 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  39.67 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  40.87 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  46.74 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  39.83 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36.28 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  38.33 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  38.94 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  38.33 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  38.79 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.52 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  43.52 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  37.86 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0908  CrcB protein  46.15 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.862739  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.57 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  35.43 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  38.37 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  37.3 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  34.43 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  37.7 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  45.79 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  36.61 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  39.13 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4411  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  30.58 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.61 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>