More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0556 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0570  voltage-gated chloride channel family protein  97.94 
 
 		 437 aa  813    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0556  voltage gated chloride channel family protein  100 
 
 		 437 aa  855    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01048  Cl- channel, voltage gated  45.5 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06118  Cl- channel, voltage gated  45.5 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3703  Chloride channel core  45.37 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.474043  hitchhiker  0.000487156 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3981  Chloride channel core  44.1 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4094  Chloride channel core  44.1 
 
 		 426 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.089965  normal  0.148511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1732  chloride channel core  42.68 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6970  Cl- channel voltage-gated family protein  42.47 
 
 		 452 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.06762  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1803  hypothetical protein  46.38 
 
 		 431 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2302  Cl- channel, voltage gated  42.82 
 
 		 413 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3731  chloride channel core  43.56 
 
 		 413 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.597122 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4570  Cl- channel, voltage gated  43.32 
 
 		 413 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.615491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3793  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.32 
 
 		 413 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258404  normal  0.231279 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0545  Chloride channel core  46.04 
 
 		 417 aa  353  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0459516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4619  voltage-gated chloride channel family protein  45.26 
 
 		 452 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1486  Cl- channel, voltage gated  45.26 
 
 		 448 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0508  voltage-gated chloride channel  43.72 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4940  chloride channel core  43.53 
 
 		 413 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.530885 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5519  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.16 
 
 		 413 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.720023  normal  0.391886 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1603  voltage-gated chloride channel  43.48 
 
 		 436 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845541  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0961  voltage-gated chloride channel  43.48 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0837  Cl- channel, voltage-gated family protein  45.67 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.115914  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2677  chloride channel (ClC) family protein  43.24 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267166  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3685  chloride channel core  43.53 
 
 		 468 aa  343  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.36379  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0225  voltage-gated chloride channel  45.5 
 
 		 427 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0261  voltage-gated chloride channel  45.5 
 
 		 427 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1406  voltage-gated chloride channel  45.5 
 
 		 427 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4018  Chloride channel core  43.75 
 
 		 453 aa  342  8e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94873  normal  0.248767 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2534  chloride channel (ClC) family protein  43.24 
 
 		 435 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2064  chloride channel core  44.39 
 
 		 440 aa  326  5e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0178242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2371  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.95 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.596743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1136  hypothetical protein  41.56 
 
 		 482 aa  319  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0839262  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2639  Chloride channel core  38.81 
 
 		 457 aa  302  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.311853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3539  Chloride channel core  42.64 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1026  chloride channel core  43.83 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.724519  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1199  chloride channel protein EriC  37.66 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00235154  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2180  Cl- channel, voltage gated  38.42 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000426596  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0541  voltage-gated chloride channel family protein  37.99 
 
 		 398 aa  239  1e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2620  Cl- channel voltage-gated family protein  33.49 
 
 		 452 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3273  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.2 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2367  Chloride channel core  36.23 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0274  Chloride channel core  34.61 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1145  chloride channel protein EriC  37.63 
 
 		 408 aa  217  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000190492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0292  chloride channel core protein  35.24 
 
 		 455 aa  216  8e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.158347  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1160  chloride channel core  35.93 
 
 		 494 aa  203  4e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  29.17 
 
 		 606 aa  119  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0832  chloride channel  29.73 
 
 		 585 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2090  Cl- channel, voltage gated  26.21 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0263619  hitchhiker  0.00000244814 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  27.03 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  27.59 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.42 
 
 		 580 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  28.07 
 
 		 614 aa  99.8  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  28.92 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  27.11 
 
 		 586 aa  95.9  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1953  Chloride channel core  25.44 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0629221  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13300  chloride channel protein EriC  24.19 
 
 		 414 aa  94  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1059  Chloride channel core  27.98 
 
 		 625 aa  94  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.68 
 
 		 754 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0939  Cl- channel voltage-gated family protein  25.75 
 
 		 582 aa  91.3  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.564922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  26.48 
 
 		 613 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4064  Cl- channel, voltage gated  27.68 
 
 		 602 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  27.67 
 
 		 587 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25.26 
 
 		 598 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.59 
 
 		 591 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  28.17 
 
 		 528 aa  84.3  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  27.08 
 
 		 584 aa  84.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  25.13 
 
 		 559 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.13 
 
 		 612 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2446  chloride channel core  25.96 
 
 		 603 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2452  Cl- channel voltage-gated family protein  26.13 
 
 		 603 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1071  hypothetical protein  26.49 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1681  Chloride channel core  27.42 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.366946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  25 
 
 		 577 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2417  chloride channel core protein  25.21 
 
 		 612 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2504  Chloride channel core  25.21 
 
 		 634 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.244911  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  29.75 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  25 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.56 
 
 		 589 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1650  Chloride channel core  25.83 
 
 		 604 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1362  Chloride channel core  26.05 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00220045  normal  0.308625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  24.73 
 
 		 613 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  29.75 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  25.25 
 
 		 602 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1443  Cl- channel, voltage gated  30.46 
 
 		 638 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  28.73 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  26.15 
 
 		 579 aa  77.4  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2770  putative chloride channel protein, voltage gated  26.74 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302923  normal  0.298646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  27.88 
 
 		 569 aa  77  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  24.36 
 
 		 470 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  26.28 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0455  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  23.86 
 
 		 560 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  22.72 
 
 		 589 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.4 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  27.47 
 
 		 563 aa  73.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  26.55 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  24.48 
 
 		 593 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0690  Cl- channel, voltage-gated family protein  22.33 
 
 		 591 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.04 
 
 		 579 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  30.73 
 
 		 605 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>