More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1590 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  55.8 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  54.14 
 
 		 180 aa  207  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  54.14 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  53.59 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  52.49 
 
 		 180 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  52.49 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  52.49 
 
 		 180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  50.83 
 
 		 180 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  53.59 
 
 		 180 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  54.14 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  44.2 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  52.07 
 
 		 169 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  41.67 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  43.09 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  42.62 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  39.47 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  40 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  40.54 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  40 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  40.76 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  42.26 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  40 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  40.76 
 
 		 190 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  39.13 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  38.33 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  39.13 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  43.75 
 
 		 186 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  37.43 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  36.26 
 
 		 179 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  42.05 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  36.26 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  36.84 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  36.84 
 
 		 179 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  36.84 
 
 		 179 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  34.46 
 
 		 188 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  36.84 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  36.84 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  36.84 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  36.84 
 
 		 176 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  33.9 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  33.9 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  33.9 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  33.33 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  32.77 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  32.77 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0438  phage integrase, N-terminus  52.04 
 
 		 97 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0989457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  33.33 
 
 		 188 aa  107  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  36.26 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  32.96 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  32.4 
 
 		 188 aa  104  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  33.89 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  33.89 
 
 		 197 aa  92  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  31.72 
 
 		 195 aa  89  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  31.15 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  31.15 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  33.7 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  30.05 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  30.6 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  33.15 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  31.11 
 
 		 186 aa  84.3  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 186 aa  84.3  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  31.52 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  29.67 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  52.78 
 
 		 73 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  29.63 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  29.14 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  30.86 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2717  hypothetical protein  26.99 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  30.97 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.68 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  22.42 
 
 		 308 aa  62  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.21 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  26.58 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  25.83 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  27.81 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  24.36 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  24.56 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  21.74 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  25.81 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3924  integrase family protein  29.61 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.733894 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  30.34 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  26.49 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  25.42 
 
 		 297 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  24.73 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  26.62 
 
 		 305 aa  57.8  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  28.08 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  25.87 
 
 		 303 aa  57.8  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>