More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00610 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB00610  DEAD box RNA helicase, putative  100 
 
 
802 aa  1640    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.31511  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00583  ATP-dependent RNA helicase dbp10 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU7]  37.32 
 
 
936 aa  513  1e-144  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_80003  predicted protein  36.23 
 
 
931 aa  457  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.586246  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40877  predicted protein  47.75 
 
 
546 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26853  predicted protein  41.87 
 
 
476 aa  310  5e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02650  conserved hypothetical protein  37.82 
 
 
808 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.25 
 
 
488 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.308485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2955  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.69 
 
 
487 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3137  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.19 
 
 
423 aa  239  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.417065  normal  0.231067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.33 
 
 
437 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.6 
 
 
383 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04233  ATP-dependent rRNA helicase rrp3 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5E7]  36.93 
 
 
465 aa  234  5e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.078552  normal  0.363381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.48 
 
 
485 aa  234  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.75 
 
 
533 aa  234  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0791  putative ATP-dependent RNA helicase RhlE  32.51 
 
 
624 aa  233  1e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000437602  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  33.41 
 
 
799 aa  232  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.82 
 
 
463 aa  232  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2609  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 
577 aa  232  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1199  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.48 
 
 
578 aa  232  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.09 
 
 
425 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.83 
 
 
439 aa  231  4e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05770  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.33 
 
 
551 aa  231  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000174624  hitchhiker  0.00467584 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.4 
 
 
453 aa  231  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3042  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.68 
 
 
478 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00902237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.4 
 
 
453 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.24 
 
 
454 aa  230  7e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.4 
 
 
453 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.4 
 
 
453 aa  230  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.4 
 
 
453 aa  230  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.24 
 
 
454 aa  230  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.96 
 
 
448 aa  230  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  35.24 
 
 
454 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.24 
 
 
454 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.24 
 
 
454 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.24 
 
 
455 aa  229  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  35.24 
 
 
454 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.24 
 
 
454 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.24 
 
 
454 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2902  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.92 
 
 
598 aa  229  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0368123 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.29 
 
 
403 aa  229  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000744604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  33.18 
 
 
697 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0570  DNA/RNA helicase  34.2 
 
 
432 aa  229  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1278000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2169  DEAD/DEAH box helicase-like  34.33 
 
 
574 aa  229  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1916  hypothetical protein  35.31 
 
 
575 aa  229  2e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.12 
 
 
492 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  34.99 
 
 
462 aa  228  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.59 
 
 
514 aa  228  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.66 
 
 
618 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
471 aa  227  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048644  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.16 
 
 
423 aa  227  8e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.5 
 
 
565 aa  226  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.16 
 
 
451 aa  226  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2935  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.56 
 
 
476 aa  225  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.05 
 
 
678 aa  226  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0919  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.49 
 
 
432 aa  225  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000178347  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  37.94 
 
 
405 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.93 
 
 
570 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  35.29 
 
 
446 aa  224  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.66 
 
 
507 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.59 
 
 
574 aa  224  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.24 
 
 
571 aa  224  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.25 
 
 
453 aa  224  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.756474 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0914  ATP-dependent RNA helicase RhlE  33.51 
 
 
447 aa  223  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131359  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.92 
 
 
581 aa  223  9e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
626 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.34 
 
 
515 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.04 
 
 
579 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
513 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  34.01 
 
 
644 aa  223  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
526 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  35.24 
 
 
543 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_172  hypothetical protein  32.91 
 
 
561 aa  223  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000114775  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
525 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2639  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.41 
 
 
525 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.147285  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.59 
 
 
494 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.84 
 
 
626 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1528  ATP-dependent RNA helicase RhlE  35.31 
 
 
477 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.515167  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.84 
 
 
630 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.84 
 
 
627 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.25 
 
 
418 aa  223  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
525 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.16 
 
 
599 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  36.48 
 
 
561 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1567  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.08 
 
 
446 aa  221  3.9999999999999997e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.951835  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.77 
 
 
447 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  32.55 
 
 
530 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0183  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.17 
 
 
560 aa  221  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.475928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.76 
 
 
466 aa  221  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57234  ATP-dependent rRNA helicase RRP3  37.47 
 
 
396 aa  221  5e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0347564  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
491 aa  221  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.16 
 
 
516 aa  220  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0874  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.66 
 
 
471 aa  221  6e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0942058  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  34.16 
 
 
518 aa  220  7e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  33.84 
 
 
622 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.79 
 
 
627 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0169  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.92 
 
 
561 aa  220  7.999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000471101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.79 
 
 
627 aa  220  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.89 
 
 
590 aa  220  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.57 
 
 
628 aa  220  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.41 
 
 
643 aa  220  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>