More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06630 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA06630  ribulose-phosphate 3-epimerase, putative  100 
 
 
224 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50761  D-ribulose-5-phosphate 3- epimerase  47.96 
 
 
232 aa  231  6e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07588  ribulose-phosphate 3-epimerase (AFU_orthologue; AFUA_2G15190)  44.44 
 
 
252 aa  219  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.337987  normal  0.331774 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41053  predicted protein  46.76 
 
 
231 aa  209  3e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20015  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.66 
 
 
227 aa  193  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0240  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.64 
 
 
221 aa  185  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1989  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
217 aa  185  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1707  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.67 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2302  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.99 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.492163  hitchhiker  0.000182482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3105  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.71 
 
 
231 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.486623  normal  0.395084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1855  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.44 
 
 
224 aa  182  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.593821 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2512  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
214 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000411423  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3908  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3902  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000909006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3711  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000326882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3601  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000335974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3683  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00141472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3998  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000394109  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3874  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9214700000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0067  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  44.34 
 
 
221 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3619  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 
214 aa  181  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498078  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1327  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.55 
 
 
217 aa  180  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3959  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.04 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2385  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.01 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2432  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.01 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.838808  normal  0.56019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2426  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.01 
 
 
224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916461  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1284  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.04 
 
 
214 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000283492  hitchhiker  0.00041943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1077  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2907  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.62 
 
 
243 aa  178  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0858  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.19 
 
 
223 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.410208  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3728  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.74 
 
 
225 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0237656  normal  0.0198075 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0508  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
228 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471552  normal  0.840535 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3623  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
228 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3114  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.26 
 
 
224 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2858  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0465  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.710301  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0441  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
228 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1716  ribulose-phosphate 3-epimerase  42.45 
 
 
218 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0463  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.18 
 
 
227 aa  175  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0731  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.53 
 
 
224 aa  175  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0365158  normal  0.685056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3494  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.62 
 
 
238 aa  175  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00334689  hitchhiker  0.000085645 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11437  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 
232 aa  175  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00955646  normal  0.147382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5433  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
219 aa  175  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal  0.901905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2597  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.22 
 
 
209 aa  174  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.943131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1959  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.32 
 
 
218 aa  174  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2446  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  41.18 
 
 
239 aa  174  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.87044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3649  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  40.93 
 
 
224 aa  174  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002331  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.07 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.556001  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0156  ribulose-phosphate 3-epimerase  40 
 
 
223 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1586  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.19 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2352  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.85 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117737  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17265  predicted protein  43.07 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27529  hitchhiker  0.00915674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2043  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.42 
 
 
211 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2696  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.73 
 
 
227 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1769  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.74 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3527  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.68 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2726  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.63 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3593  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.68 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12473  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.65 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3554  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.07 
 
 
228 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3573  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.07 
 
 
243 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.715981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3581  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.07 
 
 
228 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1205  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.84 
 
 
211 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3851  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.53 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0535  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.07 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.353597  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0938  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.07 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1908  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.07 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3680  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.53 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3755  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.53 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0642  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.07 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5220  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.44 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1653  Ribulose-phosphate 3-epimerase  43.78 
 
 
217 aa  171  9e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.123054 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0177  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.55 
 
 
223 aa  171  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3971  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  42.13 
 
 
224 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1069  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.15 
 
 
221 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15700  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.38 
 
 
228 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0491  Ribulose-phosphate 3-epimerase  39.07 
 
 
221 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0833  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.03 
 
 
216 aa  169  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2997  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.64 
 
 
221 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00024  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.25 
 
 
223 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2202  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.53 
 
 
236 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.780277  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1911  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.64 
 
 
230 aa  168  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.822201  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0264  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.17 
 
 
225 aa  168  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241717  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3682  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.07 
 
 
225 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.341104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3789  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.07 
 
 
225 aa  168  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1432  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.16 
 
 
220 aa  168  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2689  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.38 
 
 
234 aa  167  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3374  ribulose-phosphate 3-epimerase  40.57 
 
 
221 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2879  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.07 
 
 
242 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.403873  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3121  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.89 
 
 
241 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.798582  normal  0.13274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03238  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.07 
 
 
225 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.841593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0194  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.51 
 
 
221 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000208894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03190  hypothetical protein  38.07 
 
 
225 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.725315  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1048  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.77 
 
 
226 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000483627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3662  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.07 
 
 
225 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383295  normal  0.0239622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3582  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.07 
 
 
225 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.111758  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4690  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.07 
 
 
225 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3763  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.07 
 
 
225 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0483274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1673  ribulose-5-phosphate 3-epimerase  38.81 
 
 
230 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.442392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0714  ribulose-phosphate 3-epimerase  39.05 
 
 
222 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.23803  normal  0.485653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>