More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA02270 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  65.89 
 
 		 772 aa  987    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  66.08 
 
 		 722 aa  973    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  100 
 
 		 762 aa  1575    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  60.54 
 
 		 770 aa  904    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24772  predicted protein  59.57 
 
 		 801 aa  851    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  64.23 
 
 		 467 aa  620  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.87 
 
 		 473 aa  619  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.23 
 
 		 470 aa  615  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  64.08 
 
 		 473 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  64.29 
 
 		 470 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  64.51 
 
 		 469 aa  614  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  63.18 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  63.45 
 
 		 469 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  64.51 
 
 		 469 aa  609  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  64.51 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  64.51 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  62.21 
 
 		 468 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  63.83 
 
 		 475 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  63.66 
 
 		 470 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  63.67 
 
 		 469 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  63.67 
 
 		 469 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  63.26 
 
 		 468 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  63.2 
 
 		 472 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  63.12 
 
 		 468 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  63.83 
 
 		 475 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  62.86 
 
 		 478 aa  602  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  63.26 
 
 		 470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  62.94 
 
 		 469 aa  601  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  62 
 
 		 468 aa  600  1e-170  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  62.94 
 
 		 480 aa  599  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  63.05 
 
 		 469 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  62.94 
 
 		 469 aa  599  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  63.26 
 
 		 469 aa  597  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  62.82 
 
 		 466 aa  597  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0135  isopropylmalate isomerase large subunit  64.17 
 
 		 468 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0383908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  62.42 
 
 		 468 aa  592  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  61.54 
 
 		 479 aa  592  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  63.18 
 
 		 469 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  63.39 
 
 		 469 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2520  isopropylmalate isomerase large subunit  64.44 
 
 		 478 aa  588  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1990  isopropylmalate isomerase large subunit  62.97 
 
 		 469 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508129  normal  0.146532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  63.18 
 
 		 469 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.82 
 
 		 469 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  62.89 
 
 		 469 aa  580  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2475  isopropylmalate isomerase large subunit  62.55 
 
 		 469 aa  582  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891959  normal  0.311686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0085  isopropylmalate isomerase large subunit  62.92 
 
 		 467 aa  580  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362256  normal  0.223362 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2508  isopropylmalate isomerase large subunit  63.88 
 
 		 467 aa  582  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  59.41 
 
 		 480 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  62.53 
 
 		 470 aa  582  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6850  isopropylmalate isomerase large subunit  62.89 
 
 		 469 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4367  isopropylmalate isomerase large subunit  62.89 
 
 		 469 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3463  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  62.92 
 
 		 465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0762821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  61.84 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1729  isopropylmalate isomerase large subunit  61.84 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.405505  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  62.34 
 
 		 469 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  61.54 
 
 		 479 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  61.84 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  62.34 
 
 		 469 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  61.84 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  61.84 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  61.84 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  62.05 
 
 		 469 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3229  isopropylmalate isomerase large subunit  62.42 
 
 		 473 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  62.34 
 
 		 469 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  61.76 
 
 		 470 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2582  isopropylmalate isomerase large subunit  62.42 
 
 		 473 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  62.03 
 
 		 477 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  61.34 
 
 		 470 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  62.34 
 
 		 469 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0626  isopropylmalate isomerase large subunit  61.02 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3844  isopropylmalate isomerase large subunit  61.92 
 
 		 469 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777096 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3608  isopropylmalate isomerase large subunit  62.16 
 
 		 473 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2129  isopropylmalate isomerase large subunit  62.53 
 
 		 476 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  63.26 
 
 		 473 aa  575  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3340  isopropylmalate isomerase large subunit  61.92 
 
 		 469 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184073  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  60.34 
 
 		 470 aa  569  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1795  isopropylmalate isomerase large subunit  61.91 
 
 		 490 aa  571  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.367399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5235  isopropylmalate isomerase large subunit  62.05 
 
 		 488 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.71536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2164  isopropylmalate isomerase large subunit  61.92 
 
 		 479 aa  569  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  61.51 
 
 		 469 aa  567  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1180  isopropylmalate isomerase large subunit  62.18 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  61.72 
 
 		 467 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  59.25 
 
 		 469 aa  565  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4227  isopropylmalate isomerase large subunit  60.25 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.888543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4053  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  59.62 
 
 		 474 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1057  isopropylmalate isomerase large subunit  59.96 
 
 		 469 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.960077  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1675  isopropylmalate isomerase large subunit  61.54 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  60.21 
 
 		 480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11100  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  57.99 
 
 		 479 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  60.54 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  59.03 
 
 		 469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1223  isopropylmalate isomerase large subunit  61.25 
 
 		 473 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10034  normal  0.0157674 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3039  isopropylmalate isomerase large subunit  60.82 
 
 		 483 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  59.33 
 
 		 466 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0077  isopropylmalate isomerase large subunit  59.33 
 
 		 466 aa  559  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.387894 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2935  isopropylmalate isomerase large subunit  61.84 
 
 		 469 aa  562  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0066  isopropylmalate isomerase large subunit  59.33 
 
 		 466 aa  559  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1967  isopropylmalate isomerase large subunit  58.66 
 
 		 481 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0620  isopropylmalate isomerase large subunit  59.54 
 
 		 466 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2135  isopropylmalate isomerase large subunit  58.59 
 
 		 481 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>