More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0718 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0718  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 290 aa  587  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.414677  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1634  regulatory protein LysR  33.57 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0436  LysR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.580361  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0478  transcriptional regulator, LysR family  26.86 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0101609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1877  LysR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000269934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2785  transcriptional regulator, LysR family  29.37 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1615  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.979938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2058  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 275 aa  72  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0947  transcriptional regulator, LysR family  24.18 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0475  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4625  LysR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00069577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1976  transcriptional regulator, LysR family  21.79 
 
 		 294 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.59481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3382  LysR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2061  LysR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  22.75 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0449  LysR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00010985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0630  transcriptional regulator, LysR family  25.19 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000148774  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4331  LysR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5256  LysR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5603  LysR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4785  transcriptional regulator, LysR family  27.24 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.6594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1954  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1161  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0467249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1148  transcriptional regulator, LysR family  23.08 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000219344  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4787  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  18.28 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1398  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1345  transcriptional regulator, LysR family  37.61 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  23.64 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4044  LysR family transcriptional regulator  19.93 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0668  transcriptional regulator, LysR family  25.13 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0273303  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_003296  RS03179  transcription regulator protein  39.64 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379949  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3202  transcriptional regulator, LysR family  25.37 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4394  LysR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6901  transcriptional regulator, LysR family  24.53 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0269  LysR substrate-binding  24.65 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5068  LysR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.728384 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2199  transcriptional regulator, LysR family  22.12 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2885  LysR family transcriptional regulator  22.71 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0745668  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0254  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1683  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7812  transcriptional regulator, LysR family  33.64 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0902  transcriptional regulator, LysR family  23.69 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3536  transcriptional regulator, LysR family  24.35 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246229  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1772  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4759  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.658857  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0055  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0265  transcriptional regulator, LysR family  24.06 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.399424  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0883  transcriptional regulator, LysR family  21.53 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000429967 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0476  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000749343 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1305  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2533  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0091  LysR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0134  transcriptional regulator HdfR  22.67 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2081  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1884  LysR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000190321  normal  0.897251 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2025  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.639957  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1152  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1144  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3361  transcriptional regulator, LysR family  21.91 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02817  transcriptional regulator LysR family  24.76 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  42.19 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0699  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4389  LysR family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4548  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4384  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1223  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0411  LysR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1694  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4902  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4768  transcriptional regulator, LysR family  39.33 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2423  transcriptional regulator, LysR family  22.09 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.896405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0770  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3792  LysR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0906845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1184  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1251  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.392675  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6402  LysR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0987  LysR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.830946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0959  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.269179  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1682  putative transcriptional regulator  22.22 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177927  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3528  transcriptional regulator, LysR family  24.38 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3893  LysR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.811179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5828  transcriptional regulator, LysR family  25.12 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  25.86 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1014  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1093  LysR substrate-binding  24.34 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2902  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.187711  normal  0.331518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1859  LysR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.430795  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1222  transcriptional regulator, LysR family  24.34 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2466  LysR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4197  LysR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0325  LysR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>