More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7812 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7812  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 317 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2847  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.109493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3902  LysR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 319 aa  225  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3898  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.522944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1161  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0467249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1683  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0254  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1772  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2070  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1142  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1130  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 318 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2032  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4389  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2065  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1251  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.392675  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1223  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0770  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973031  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1305  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1152  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 320 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2081  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 320 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2533  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 320 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1144  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0699  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 320 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4670  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  hitchhiker  0.00186288 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0325  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1101  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0099  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1244  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0599  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3995  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 297 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0457  LysR, substrate-binding  31.35 
 
 		 312 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0935701  normal  0.110624 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  25.29 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  25.29 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  24.9 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  24.9 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5151  LysR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.58822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  24.9 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  24.9 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  24.9 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.58 
 
 		 300 aa  97.1  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0896  LysR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 291 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2671  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0656105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4637  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 306 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 305 aa  95.9  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2565  LysR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2618  LysR substrate-binding  24.16 
 
 		 292 aa  95.5  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2118  LysR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 294 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  27.71 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 306 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3179  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4132  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.977393  normal  0.0579117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2421  LysR substrate-binding  23.14 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2563  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 308 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00385912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3638  transcriptional regulator, LysR family  26.19 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3724  LysR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.282606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0350  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2537  LysR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4467  LysR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 300 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0400691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3737  LysR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.440992 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4596  LysR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 303 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651674 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1855  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 308 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0055  LysR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 309 aa  92.8  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2694  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000201069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1253  transcriptional regulator, LysR family  26.19 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0013481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2773  transcriptional regulator, LysR family  26.19 
 
 		 308 aa  92.8  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000207011  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  27.69 
 
 		 303 aa  92.4  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02308  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.19 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000841101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02269  hypothetical protein  26.19 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000658143  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4080  LysR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1270  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000010142  hitchhiker  0.000508597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2543  LysR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 308 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000981621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4600  LysR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05312  transcription regulator protein  31.02 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57895  normal  0.489476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5892  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1001  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.411347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4749  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0228204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5703  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199598 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3618  LysR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2421  LysR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.324279 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  30.2 
 
 		 294 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1842  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.330776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6115  transcriptional regulator, LysR family  26.16 
 
 		 299 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3156  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.3 
 
 		 325 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.46065  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  27.13 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4879  transcriptional regulator, LysR family  28.31 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 316 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38680  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46680  Transcriptional regulator, LysR-family  32.81 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4972  transcriptional regulator, LysR family  25.21 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5121  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1907  transcriptional regulator  27.89 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17790  LysR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 295 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>