More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0599 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0599  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  634    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1244  LysR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 316 aa  328  8e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4670  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  hitchhiker  0.00186288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2847  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 323 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.109493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4389  LysR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7812  transcriptional regulator, LysR family  29.41 
 
 		 317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1142  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.26532 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1223  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2070  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.83599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0770  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973031  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1130  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1251  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.392675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2065  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3902  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1305  LysR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2533  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2081  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.11964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1144  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0699  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3898  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.522944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2032  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1152  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1772  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.6565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0254  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1683  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0193555  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1161  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0467249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1618  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0301028 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1551  LysR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0638  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.327526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0785  LysR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.352567  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0675  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1596  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2242  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2155  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1997  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2060  LysR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159484  normal  0.0317829 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5172  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.106584 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3437  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.657554 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4643  LysR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1818  LysR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 296 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4985  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3084  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5283  LysR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 305 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.770818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0367  LysR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.968869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1630  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 296 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.48911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49590  transcriptional regulator  25.87 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4378  LysR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 305 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5120  LysR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809897 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5195  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1008  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0100  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0325  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1101  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1381  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.727507  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0155  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150061  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0495  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.212291  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0099  LysR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 277 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1455  LysR family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  28.26 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.26 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0048  transcriptional regulator, LysR family  24.62 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.968768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.26 
 
 		 302 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.26 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4054  LysR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 298 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.26 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.26 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  28.26 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.26 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.26 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2317  LysR family regulatory protein  26 
 
 		 302 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1095  LysR family transcriptional regulator  26 
 
 		 316 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2782  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2194  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0690526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2962  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478402  normal  0.502508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3143  LysR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2574  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3543  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.86 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1659  LysR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4295  LysR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3231  LysR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1974  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.601585  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2588  transcriptional regulator, LysR family protein  23.74 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6420  LysR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.83075  normal  0.614202 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5408  LysR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133517  normal  0.0100846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3205  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.241885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3293  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1918  LysR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4054  LysR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5671  LysR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.840206  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3544  transcriptional regulator, LysR family  25.81 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0349237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3917  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46060  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.89621 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4312  LysR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.765284 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6363  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4253  transcriptional regulator, LysR family  25.98 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.944931 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4141  transcriptional regulator, LysR family  25.98 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0396  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.14 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3439  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1040  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0665507  normal  0.490523 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>